原肠（archenteron）是在 囊胚 时期通过原肠形成过程完成的，它最终会形成动物的 消化道 。在多细胞动物的发育过程中，原肠是由 原肠胚 内层形成的腹壁，其内腔称为原肠腔（gastrocoel），有时也直接将原肠腔称为原肠。
原肠形成过程
原肠的形成是一个关键的发育过程，其中一些 细胞 向囊胚腔内折叠形成内凹。这些细胞重新排列，使得宽而浅的凹陷变成细而深的凹陷，最终在内 胚层 细胞的引导下，形成细长的管状结构，即原肠。原肠的形成是通过细胞的汇聚和延伸完成的。
在原肠形成期，原肠连接外层的部位，即原肠腔向外的开口，相当于原口。随着原肠的形成，一般 囊胚 腔缩小或消失。不同的动物，其形成原肠的胚层或仅形成肠管，或者除 内胚层 外也包括 中胚层 ，以后除肠管外尚产生 脊索 、 体节 等。在某些动物中，原肠为前后延伸的简单圆筒（如 海胆 ），而在有些动物中，原肠显著地表现出背腹的差异（如 脊椎动物 ）。
原肠的形成涉及丝状 伪足 ，这是由间质 细胞 构成的细长纤维，它们帮助原肠顺利地被拉过囊胚腔，到达另一端。在这个过程中，内胚层的原肠细胞会与外胚层的原肠细胞融合，至此原肠形成已经完成，具有消化管的功能。原肠末端的开口称为胚孔。
在 两栖纲 与鱼类中，原肠形成过程中遗留下来的痕迹称为胚孔痕，而在鸟类与 哺乳纲 中，遗留的痕迹则称为原痕或原线。这些痕迹均由背胚孔与原结（又称恒生结）所控制。