生物 化学 ( biochemistry), 是研究生物体中的化学进程的一门学科,简称为生化。 是用 化学 、物理学和 生物学 的原理和方法,研究生物体内物质的化学组成、结构和功能,以及生命活动过程中各种化学变化过程及其与环境之间相互关系的基础生命学科。
生物化学早期主要采用化学、物理学和数学的原理和方法,研究各种形式的生命现象,随着研究的发展,融入了 生理学 、 细胞生物学 、 遗传学 和免疫学等的理论和技术,加之 生物信息学 的介入,使之与众多学科有着广泛的联系和交叉。 主要用于研究细胞内各组分,如 蛋白质 、 糖类 、 脂类 、 核酸 等 生物大分子 的结构和功能。在生物化学研究中,主要对 细胞 代谢和 内分泌系统 进行研究。生物化学的其他研究领域包括 遗传密码 ( 脱氧核糖核酸 和 核糖核酸 )、蛋白质生物合成、跨膜运输(membranetransport)以及细胞信号 转导 。 1946年 郑集 教授在前中央大学医学院于成都布后街成立生物化学研究所。这是中国生物化学发展史上的第一个生物化学专业研究所。 生物化学的三个主要分支:普通生物化学研究包括动植物中普遍存在的生化现象;植物生物化学主要研究 自养生物 和其他植物的特定生化过程;而人类或医药生物化学则关注人类和人类疾病相关的生化性质。
生物 化学 技术是化学技术在 生命科学 领域的应用,生物化学的迅猛发展加快了现代生物化学技术的开发和应用,在现代工业、农业、食品、医药行业日益发挥巨大作用。 例如在医学领域,利用 来生产新型的药物和 疫苗 ,如 胰岛素 、生长激素、 、红细胞生长素、乙肝疫苗和 免疫细胞 介素―2等基因工程药物应用。
发展历史
17世纪初, 比利时 海尔蒙特(J.B. van Helmont,1577-1644)第一个尝试用化学方法去了解人类和生物的生理构造,这是生物化学的早期萌芽。可以将生物化学的发展史粗略地划分为三个阶段。
静态生物化学时期(18世纪70年代-1903年)
18世纪70年代至20世纪初, 已发展为独立的学科, 化学 体系也比较完整,有些科学家尝试用化学的基本原理解释生理现象,为生物化学的诞生奠定了基础。
1770-1774年, 英国 化学家 (J.Priestly)发现了O 2 ,并指出动物消耗氧而植物产生氧。1779-1796年,荷兰人简·英格豪斯(Jan Ingenbousz)证明在光照条件下绿色植物吸收CO 2 并放出O 2 。1785年, 法国 化学家 (Lavoisier)证明,动物呼吸是体内缓慢和不发光的燃烧,吸进O 2, 呼出CO 2 ,同时放出 热能 ,首次提出动物身体发热源于体内物质氧化,这是生物化学中生物氧化和能量代谢的开端。
1828年, 德国 化学家 (F.Wohler)在实验室用 合成了 。成功合成尿素,改变了人们认为有机物只能在生物体内合成的观点,开阔了生物化学的研究视野,有人甚至提出把尿素合成作为生物化学诞生的标志。1840年,德国化学家 (J. Von Liebig,1803-1873)提出了糖、 脂类 、 蛋白质 及其 新陈代谢 ( metabolism)的概念。
1849年, 法国 微生物学家 (Louis Pasteur,1822-1895)开始进行发酵的研究;1857年提出 酒精发酵 是 过程,必须是活的酵母 细胞 才能进行。而 德国 化学家李比希等人坚持酒精发酵是纯粹的 化学过程 。从此展开了关于发酵本质问题长达半个世纪的论战。
1868年, 瑞士 生物学家 (F.Miescher,1844-1895)从外科绷带脓液的 白细胞 核中发现一种含有磷和氮的物质,命名为 核素 ;1889年,阿尔特曼(R.Altmann)将核素更名为 核酸 ;1885-1900年间,德国生理学家柯塞尔(A.Kossel,1853-1927)和他的学生琼斯(W.Johnew,1865-1935)、莱文( Levene,1896-1940)证实核酸由不同的 组成,最简单的 结构是 磷酸构成的 核苷酸 。
1877年, 德国 生理化学家候普-赛勒(Hoppe-Seyler)因为 血色素 的工作,首先提出“Biochemie”一词,译成 英语 为“Biochemistry”,即生物化学,并将其定义为所有与 生物分子 有关的一切内容。
1897年,德国布赫纳两兄弟((Eduard Buchner & Hans Buchner)成功地从酵母细胞分离出具有发酵作用的物质,统一了双方的认识。这是一次质的飞跃,为 ——酶的应用奠定了基础。1903年, 德国 化学家纽伯格(C.Neuberg)正式提出“生物化学”的概念,从此诞生了一个新领域——生物化学,形成了生物化学这门独立的学科。
这个时期, 用 的观点研究生物的生理问题,取得了不少成果,主要是分析和研究生物体的化学组成及其 性质,发现生物体主要由糖、脂、 蛋白质 和 核酸 四大类有机物质组成。科研成果以静态描述为主,是生物化学发展的准备和酝酿阶段。
动态生物化学时期(1903—1953年)
20世纪初至20世纪50年代,随着分析鉴定技术的进步,尤其是微量分析技术、 标记技术等手段的应用, 维生素 、激素、酶相继发现,酶的化学本质和作用机理基本阐明,物质代谢、能量代谢及其调控等取得了显著成果,生物化学进入蓬勃发展的动态时期,现代生物化学的框架基本确立。
德国 化学家费歇尔(E.Fischer)经过连续10年 蛋白质 的研究,于1902年提出 多肽 结构理论,1907年成功地合成了由18个氨基酸分子连成的多肽,为化学家研究蛋白质的结构提供了一个框架。1923年,维格诺德(Vgeneaud)完成了多肽激素的合成工作。20年后掀起了蛋白质的研究热潮,有关蛋白质的结构、功能不断被揭示。
1878年,德国生理学家 (F.W. Kuhne)研究发现,发酵不是酵母本身的作用,而是酵母中某种物质催化了酵解反应,把这种具有催化作用的物质定义为酶(Enzyme)。1894—1913年,费歇尔(E. )提出酶作用的锁-钥理论,以解释酶的专一性。1903年,亨利(Henri)提出了酶与 底物 作用的中间 复合物 学说。1913年,米凯利斯(Michaelis)和门顿-(Menten)总结了前人工作,推导出了酶催化反应的 方程——米氏方程,对酶反应机理的研究是一个重大的突破。1926年, 化学家萨姆纳(J.B. Sumner, 1955) 从 提取出了 结晶,并证明 酶是 蛋白质 。20世纪 30年代后,陆续发现并结晶了2000多种酶,其 本质都是蛋白质,自此确定了酶的化学本质是蛋白质的概念。
1911年, 医生冯克(C.Funk)结晶出治疗“ ”的复合维生素 B,提出“Vitamine”,意即生命胺。1907年, 德国 化学家温道斯(A. Windaus)研究了胆固醇并合成了 ,1928年因此贡献获得 ,从而推进了维生素的研究,各种维生素相继被发现。1933年, 英国 化学家霍沃思(W.V.Haworth)合成了 。1931-1935年, 瑞士 科学家卡勒(P.Karrer)先后研究并成功合成了 和维生素B。1935—1937年,德国化学家 (R.Kuhl,1900--1967)研究了 等。后来发现的许多 维生素 并非胺类,将“Vitamine”;改为“Vitamin”。
基于以上物质研究,科学家开始进一步探索物质在体内的代谢规律。1932年,英国科学家克雷伯(Hans Krebs)用组织切片实验证明了 的合成过程,提出了尿素循环;1937年,Krebs又提出了物质代谢的中枢—- 三羧酸循环 (citric acid cycle)途径。1940年, 德国 三位科学家埃姆博登(G.Embden)、迈耶霍夫(O.F Meyerhof)、帕纳斯(J.KParnas)共同提出糖酵解 代谢途径 ,简称EMP途径。1949年, 生化学家 肯尼迪 (EKennedy)和勒宁格尔(A Lehninger)证明了克努普(F.Knoop)提出的 β-氧化过程是在 线粒体 中进行的,并指出氧化的产物是 ,进一步完善了脂肪酸的β-氧化过程。至此,三大类物质的代谢途径基本确定。这个时期,对呼吸、 光合作用 、生物氧化及 ATP 在能量代谢中的地位也有了较深入的认识。不过,对 生物合成 途径的认识要晚得多,在20世纪50—60年代才阐明了氨基酸、 、咤 及脂肪酸等的生物合成途径。
与此同时, 核酸 的研究也取得很大进展。经过科塞尔(A.Kossl,1853--1927)和莱文( Levene,1869—1940)等科学家20年的共同努力,1929年由Levene提出核酸分为 和 两大类。1944年,艾沃瑞(O.T.Avery)通过 转化实验证明DNA是 遗传物质 ;1952年,美国科学家 (A. D. Hershey)和蔡斯(M Chase)分别用 同位素 "S和P标记 噬菌体 的 蛋白质 和 DNA,进一步证实了DNA是遗传物质。1950年, 生化学家 (E.Chargaff)总结出 DNA碱基互补 配对 的规律。1953年, 和 在 (M. Wilkins)和弗兰克林(R.Franklin)工作的基础上,对 进行分析,提出了DNA的双螺旋结构模型。该模型为日后提出 DNA 半保留复制 、遗传信息的 中心法则 奠定了基础,促进了 的迅速发展,被称为20世纪 自然科学 最伟大的学术成就之一。
机能生物化学时期(1953年至今)
分子生物学时期
1950年, 美国 化学家 (L.Pauling)和 (R.B.Corey)提出 角蛋白 的α螺旋 二级结构 ,为 蛋白质 空间构象的研究提供了理论基础。1953—1956年, 英国 生物学家 (F.Sanger)完成了 的氨基酸序列分析;同期, 瑞典 科学家埃德曼(P.Edman)提出 Edman降解法测定 蛋白质一级结构 。1960年,美国科学家莫尔(S. Moore)和艾德曼( Edelnan)完成了第一个酶蛋白核糖核酸酶的测序,1969年又测定了抗体蛋白的一级结构。1965年,中国人工合成了第一个具有全部生物活性的 。1984年前后, 生物化学家胡德(L.E.Hood)基于 Edman降解法相继发明出多肽自动分析仪、多肽自动合成仪。1975年,Sanger又发明了双脱氧终止法 脱氧核糖核酸 测序技术,同期,Walter Gilbert发明 法测序技术,两年后成功定序出币-X174 噬菌体 的 基因组 序列。1981年,中国首次人工合成了与 天然产物 组成和结构相同、具有全部生物活性的酵母 丙氨酸 转运RNA 。1986年,Hood利用 荧光 取代 同位素标记 ,综合 激光 和 检测,推出第一台全自动 自动测序仪,极大地促进了 核酸 测序工作。这个时期, 生物分子 的分离、纯化、鉴定的方法已经向微量、快速、精确、简便和自动化方向发展。
1953年是开创 新时代的一年,继 和Crick 推导出 脱氧核糖核酸 分子的双螺旋结构模型后,不久又提出了基因的 半保留复制 假说。1958年,梅塞尔森(M. Meselson)和斯特尔(Stahl)利用"5N标记 DNA,证实了DNA的半保留复制。在此之后十年,相继发现了DNA复制的详细机制。1958年,Crick 提出分子遗传的 中心法则 ,即遗传信息由 核酸 →核酸→ 蛋白质 。1961年又证明了 遗传密码 的通用性。1966年, 化学家 科兰纳 (H.G.Khorana)和 (M.W.Nirenberg,1927--2010)合作破译了遗传密码,这是 方面的另一杰出成就。1970年,特明(H.M. Temin)和巴梯摩尔(D.Baltimore)发现 ,补充了“中心法则”。至此,遗传信息在生物体由 到蛋白质的传递过程已经弄清。
1961年 法国 生物学家雅可布(F.Jacob)和莫诺(J.L. Monod)提出了 操纵子 学说,阐明了基因通过控制酶的 生物合成 来调节细胞代谢的模式。同年, 生物学家 (S. Brenner)阐明mRNA 碱基 序列与 染色体 中DNA互补,假定m 携带遗传信息在 核糖体 翻译成 蛋白质 。因此项工作,以上三人共获1965年 。
建立现代分子生物学,创立 基因工程 。随着人类对蛋白质、酶、 、 核糖核酸 等 生物大分子 研究的不断深入,逐渐形成了现代分子生物学。1962年 瑞士 遗传学家阿尔伯(W.Arber)证明 内切酶 的存在,1967年盖列特(M.Gellert)和莱曼(B. Lehman)发现了DNA连接酶,1972年柯恩(S. Cohen)和波耶(H.Boyer)等创建了DNA重组技术。此时,科学家越来越不满足于探索、提示生物遗传的秘密,开始跃跃欲试,设想用 工程技术 手段在分子水平上去干预生物的遗传特性,终于20世纪70年代诞生了 基因工程 。基因工程技术发展迅速,在生化领域取得重大突破。1977年, 法国 生物化学家查姆帮(Chamobon)和波盖特(Berget)发现了“断裂”基因;1981-1983年,美国科学家切赫(T.Cech)和奥特曼(S.Altman)相继发现某些 核糖核酸 具有酶的催化活性,开始了 的研究;1984年,西蒙斯(R.Simons)和 (T. )等发现了反义RNA;1985年, 化学家 (K.B.Mullis)发明 聚合酶链式反应 技术(PCR技术),从此揭开了人类向肿瘤及其他遗传性疾病研究的序幕。1990年启动“ 人类基因组 研究计划”,2003年美、中、日、德、法、英6国科学家宣布人类基因组图绘制成功,已完成的序列图覆盖人类基因组所含基因的99%。1997年, 英国 胚胎学 家威尔莫特(I. Wilmut)成功获得多莉克隆羊。2006年,重组人 抗凝血酶 Ⅲ获得上市许可,生产出世界上第一个利用 转基因动物 乳腺 生物反应器 工程药物,用于治疗先天性抗凝血酶缺失症。这个阶段,生物化学领域建树颇多,半个世纪以来产生了40多位 获得者,在现代工业、农业、食品、医药卫生等领域发挥了巨大作用。
化学生物学时期(1990年以后)
20世纪80年代中后期以来,随着各国政府和科学界对 、 材料科学 和 生物技术 等研究领域的日益重视,一大批边缘学科得以蓬勃发展。90年代后期,化学生物学(Chemical )应运而生。
相关理论
随着现代生物技术的发展, 生命科学 取得了前所未有的进步。作为生命科学核心基础的生物化学,在研究的广度和深度上均产生了巨大的变化。由它衍生而发展起来的新兴学科有 分子生物学 ( molecular biology )、结构生物学( structural biology)、 量子生物学 ( quantum biology )、 生物信息学 ( bioinformatics ))等。
学科内容
生物分子
蛋白质
生物体结构越复杂,其蛋白质种类和功能也越繁多。具有复杂空间结构的蛋白质( protein)不仅是生物体的重要结构物质之一,而且承担着各种 生物学 功能,其动态功能包括 化学 催化 反应、免疫反应、血液凝固、物质代谢调控、基因表达调控和肌收缩等功能;就其结构功能而言,蛋白质提供 结缔组织 和骨的基质、形成组织形态等。显而易见,普遍存在于生物界的蛋白质是生物体的重要组成成分和生命活动的基本物质基础,也是生物体中含量最丰富的 生物大分子 ( biomacromolecule) ,约占人体固体成分的45% ,而在 细胞 中可达细胞干重的70%以上。 蛋白质 分布广泛,几乎所有的器官组织都含有蛋白质。一个 真核生物 可有数万种蛋白质,各自有特殊的结构和功能。
尽管蛋白质的种类繁多,结构各异,但元素组成相似,主要有碳(50% ~55% )、氢(6% ~7%) 、氧( 19% ~24%)、氮(13% ~19%)和硫(0~4%)。有些蛋白质还含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、 等,个别蛋白质还含有碘。各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。由于蛋白质是体内的主要含氮物质,因此测定生物样品的含氮量就可按下式推算出 蛋白质 大致含量:每克样品含氮克数x6.25×100= 100g样品中蛋白质含量( g% )。
核酸
核酸(nucleic acid)是以 核苷酸 为基本组成单位的 生物大分子 ,具有复杂的空间结构和重要的 生物学 功能。核酸可以分为 脱氧核糖核酸 ( deoxyribonucleic acid , DNA )和核糖核酸(ribonucleic acid, 核糖核酸 )两类。DNA 存在于 细胞核 和 线粒体 内,携带遗传信息,并通过复制的方式将遗传信息进行传代。 细胞 以及生物体的 性状 是由这种遗传信息决定的。一般而言,RNA是DNA的 转录 产物,参与遗传信息的复制和表达。RNA存在于 细胞质 、细胞核和线粒体内。在某些情况下,RNA也可以作为遗传信息的载体。
维生素
维生素 是一类维持生物体正常机能所必需的低分子 有机化合物 。生物体对其需要量甚微,主要靠外界供给。维生素的种类很多,结构各异,它既不是细胞组成成分,也不能提供能量,但在体内物质代谢过程中发挥着重要作用,如许多维生素是构成 辅酶 或辅基的基本成分,有的参与特殊 蛋白质 的合成,有的是激素的 前体 。由于体内不能合成或合成量不能满足需要,故一旦外界供应不足,或机体由于各种因素引起吸收障碍时,可导致维生素缺乏病。不过如果 维生素 使用不当或长期过量服用,也可出现中毒症状。维生素可按溶解性质分为两大类:水溶性和 脂溶性维生素 。
水溶性维生素 主要包括 维生素c 和B族维生素。B族维生素又包括B、B、PP、B 、 维生素B5 、 生物素 、 叶酸 、B2等。这类维生素的特点是易溶于水,不易在体内储存,需随时摄入。它们在生物体内大多数组成酶的 辅酶 或辅基,起传递 电子 、 基团 或递氢作用。其在体内的生理功能及缺乏症是需重点掌握的内容。
脂溶性维生素主要包括 维生素a 、D、E、K,它们不溶于水,溶于脂肪或有机 溶剂 ,在体内可储存,故不许每天摄入。摄入过量会引起中毒,在生物体内各有其独特的生理功能。
酶
酶的 化学 本质是 蛋白质 。由一条肽链构成的酶称为 单体 酶( monomeric enzyme) ,如牛 胰核糖核酸酶 A、 溶菌酶 、 羧肽酶 A等。由多个相同或不同的肽链(即亚基)以非 共价键 连接组成的酶称为寡聚酶( oligomeric enzyme ) ,如蛋白激酶A和 磷酸果糖激酶1 均含有4个亚基。此外,在某一 代谢途径 中,按序 催化 完成一组连续反应的几种具有不同催化功能的酶可彼此聚合形成一个结构和功能上的整体,此即为多酶 复合物 ( multienzyme complex ) ,亦称为多酶体系( multienzyme system)。还有一些酶在一条肽链上同时具有多种不同的催化功能,这类酶称为 多功能酶 ( multifunctional enzyme)或串联酶( tandem enzyme ) ,如 氨基甲酰磷酸 合成酶Ⅱ、 天门冬氨酸 氨基甲 转移酶 和 二氢乳清酸酶 即位于同一条肽链上。
物质的代谢和调节
物质代谢是生命现象的基本特征,是生命活动的物质基础。随着物质代谢的停止,生命也将随之终止。物质代谢由许多连续的、相关的 代谢途径 所组成,而代谢途径(如糖的氧化、 脂肪酸 的合成等)又是由一系列的酶促化学反应串联形成的。正常情况下,由于机体存在着精细、严谨的调节机制,能够适应体内外环境的变化,不断调节各种物质代谢的强度、方向和速度,以确保代谢按照生理的需求,有条不紊地进行。生物体内各物质代谢途径之间相互联系、错综复杂,同时又在严密的调控下进行。
反应性质
酶的催化反应
底物 和酶的邻近与定向效应、酸碱催化、共价催化、金属离子催化、多元催化与 协同效应 、活性部位微环境。
生物氧化方式
失 电子 氧化、脱氢氧化、加氧氧化、加水脱氢氧化。
分类
参考资料
应用
医学领域
生物化学在20世纪80年代发展了 生物工程 或生物高技术的崭新领域,包括遗传工程或 基因工程 ,蛋白质工程和 酶工程 ,以及 细胞培养 、 组织培养 等体外技术,用于改造物种和生产对人类有用的产物。以生物化学的理论和技术为基础的生物工程具有广阔的前景。首先,利用生物工程的方法和技术可以改造物种,培育高抗逆性、具有特殊品质的转基因植物。其次,人们正在试图利用植物建造“植物工厂”,生产对人类有用的特殊生物化学物质。利用 生物工程 来生产新型的药物和 疫苗 ,如 胰岛素 、生长激素、 干扰素 、红细胞生长素、乙肝疫苗和白细胞介素―2等 基因工程 药物应用。 对于治疗疾病、维护人类健康有着重要的意义。
农业领域
生物化学是农业科学的重要理论基础之一,如研究植物的 新陈代谢 的各种过程,就有可能控制植物的发育,如能明确糖、 脂类 、 蛋白质 、 维生素 、生物碱及其他化合物在植物体内的合成规律,就有可能创造一定的条件,以获得优质高产的某种农作物。或在了解了某种作物的遗传特性之后,可利用 基因重组 技术,培育出优良的作物新品种。此外,农产品的储藏与加工,植物病虫害的防治, 除草剂 和 植物激素 的应用,家畜的营养问题和畜牧业 生产率 的提高, 土壤微生物学 ,土壤的肥力提高和养分的吸收等都需要应用生物化学的理论和技术手段。
工业领域
生物化学理论还可以与工业技术领域学科相结合,在材料工业、污水和废物处理方面发挥作用。前已产生了生物化学和 电子学 的边缘学科——分子生物电子学,研究 生物芯片 和 生物传感器 ,对 计算机 制造、疾病防治和生物模拟都有重要的推动作用。因此, 生物工程 产业的崛起将会极大地改变社会产业结构和人们的劳动 生产方式 。 生物化学的理论在酶工程技术的发展中也发挥重要的作用,如酿造工业,皮革工业、食品工业和发酵工业等。
食品工业领域的应用
发酵菌的酶系影响发酵产品,可以利用 基因工程 改造发酵菌。成功改造基因工程菌的例子比较多,如改造 酿酒酵母 。提高 麦芽汁 的分解率、改善啤酒的傻酸味、提高啤酒澄清度等;改造乳酸菌,提高菌种耐氧性、改善酸乳风味、抑制酸乳后酸化作用等。当前,利用发酵法成功实现了工业化生产 维生素c 、氨基酸、味精、色素和酶制剂。酶在其他工业领域也发挥了巨大作用。如: 淀粉酶 和 葡萄糖 异构酶 用于 糖浆 生产, 果胶酶 用于 果汁 加工, 纤维素 酶用于饲料添加剂提高利用率, 蛋白酶 用于肉类嫩化处理等。
在食品工业中,生化技术可用于食品营养成分分析和对人体有害、有毒物质的检测。核酸分子杂交技术、PCR技术、现代免疫技术等,逐渐用于致病微生物和转基因成分的分析检测,简单、方便、快速、准确、可靠。
生化战争
生化武器 ,即细菌生物武器和 化学 武器的统称,是严重威胁人类及其生存环境的、具有扩散性和不可控性的极端危险的武器,早就被 国际社会 严令禁止。1925年6月 日内瓦 国际会议制订《禁止在战争中使用窒息性、毒性或其他气体及细菌作战方法》的议定书,明文规定禁用细菌武器。当时 日本 拒绝批准参加这个议定书。而且为实现其继续向外侵略扩张和残酷镇压的政策,日本武力侵占 中国东北 的同时,竟然不顾世界舆论的强烈反对,公然违背国际公约,在中国以及日本国内大规模从事 生化武器 研究,并在 侵华战争 中进行残酷的 细菌战 与化学战,给中国人民带来了深重的灾难。至今仍有大量的 化学 弹药遗留在中国,依然对中国人民生命财产安全和 生态环境 构成重大威胁。