北京市疾病预防控制中心（ 北京市预防医学科学院 、 北京结核病控制研究与防治所 ）是 北京市卫生健康委员会 直属正处级公益一类事业单位。中心前身为1953年10月成立的北京市卫生防疫站。2000年6月，根据国务院关于 卫生监督 、卫生防病体制改革的总体要求，由原 北京市卫生防疫站 、 北京市劳动卫生与职业病研究所 、 北京市健康教育所 、 北京市性病防治所 合并组建北京市疾病预防控制中心，并成立 北京市预防医学研究中心 ；2021年5月，根据《 中共北京市委机构编制委员会关于市卫生健康委和市中医局所属事业单位改革有关事项的批复 》（京编委〔2021〕120号），在原北京市疾病预防控制中心、北京市预防医学研究中心、北京市 结核病 控制研究所基础上，重新组建北京市疾病预防控制中心（北京市预防医学科学院、北京结核病控制研究与防治所）。
主要职责
承担着 北京市 传染性疾病、慢性非传染性疾病、学生常见病、病媒生物传播疾病等预防与控制，开展疾病监测与预警和疾病流行规律研究；承担全市传染病疫情溯源和调查处置，突发 公共卫生 事件和灾害疫情应急处置；开展健康危害因素监测与干预工作，开展食源性、职业性、放射性、环境性等疾病的监测评价和 流行病学 调查，开展公众健康和营养状况监测与评价，提出干预策略和措施；承担全市 结核病 预防与控制；同时还肩负着首都重大政治、经济、社会活动的公共卫生保障、首都生物反恐怖袭击应急等任务；开展公共卫生与疾病预防控制的基础性和应用 性学 研究与科技创新，促进科研成果转化。
内设机构
行政职能部门
党委办公室
纪检监察 办公室
中心办公室
宣传中心
人事科
安全保卫科
财务科
审计科
质量管理办公室
科研教学管理办公室
总务后勤科
器材物资供应科
新址建设项目办公室
业务部门
南院区
公共卫生 应急中心
公共卫生信息中心
中心实验室
卫生毒理所
环境卫生所
营养与食品卫生所
消毒与 有害生物防制 所
东院区
慢性病预防与控制所
健康教育 所
职业卫生所（ 职业病 门诊部）
西院区
结核病 实验室
结核病预防控制所
结核病门诊部（结核病管理办公室）
北院区
传染病地方病控制所
免疫预防所
性病 艾滋病 防治所
放射卫生防护所
学校卫生所
北京全球健康中心办公室
基础设施
中心有四个院区，总占地面积25104.76平方米， 建筑面积 51380平方米。新址位于 通州区 宋庄镇 双埠头工业园区 ，建设用地80400平方米，建设总规模124500平方米，计划2025年7月完工。中心拥有大型设备780余台（件），具备开展生物、 化学 、 声学 、 热学 、光学和辐射等多个领域的33类1122项检测能力。拥有流感、 麻疹 、脊灰3个国家级网络实验室，以及食品非法添加物、兽药残留和有害元素3个国家参比实验室； 北京市 食物中毒诊断溯源技术重点实验室；是全国 健康促进 与教育示范基地、北京市医防融合培训基地、国家公共卫生医师资格实践技能考试与考官培训基地等全国多项培训、科研教学基地、委员会承担单位；国家卫生 有害生物防制 标准专业委员会、北京市公共卫生标准化技术委员会、北京市食品安全地方标准评审委员会3个秘书处设在我中心。
建设历程
北京疾控中心迁建项目项目位于 宋庄镇 双埠头村 ，总建筑面积约为12.45万平方米，包括综合业务楼、全球健康中心、微生物检测服务楼等9个单体。
2022年10月16日， 北京市 疾控中心迁址新建，预计2024年建成投入使用，全市各级疾控机构仪器设备配备总体达标率均高于国家标准。
2023年1月5日，北京市疾控中心新址开工建设，规划工期939天，将于2025年7月完工。
2023年6月8日上午， 通州区 建设工程“ 安全生产 月”启动仪式在北京疾控中心迁建项目施工现场举行。
政策发布
2021年1月12日，北京市疾控中心发布《网约车出租车运营期间疫情防控管理规范》。《规范》明确， 网约车 出租车如不遵守疫情防控要求，必要时将采取 熔断机制 及相关处罚措施。
现任领导
宋卫萍：党委书记、工会主席
王全意 ：中心主任
王勇 ：中心纪委书记
张小霞 ：中心副主任
庞星火 ：中心副主任
贺晓新 ：中心副主任
刘晓峰 ：中心副主任
佟颖 ：中心副主任
于建平 ：中心副主任
杨鹏 ：中心副主任
注：更新截止2024年7月