新中国成立 后，全国恢复和发展了水产教育，其中，高等水产类高校曾设五所三系，分别是上海水产大学、 大连海洋大学 、湛江水产学院、 集美大学水产学院 、 浙江海洋大学 以及 中国海洋大学 水产系、 天津农学院 水产系、华中农学院水产系。
上海水产大学
上海海洋大学 的前身可以追溯到1912年成立的 上海海洋大学水产与生命学院 。1904年，为抵御侵渔、维护海权，著名实业家、教育家 张謇 主张“渔权即海权”，向清廷倡议创办水产学校。后经黄炎培襄助和首任校长 张镠 竭力筹措，于1912年正式创办，系中国最早的水产学校之一。1927年，学校更名为 国立第四中山大学 农学院水产学校，1928年更名为 中央大学 农学院水产学校，1929年恢复江苏省立水产学校校名。1937年因八一三淞沪抗战，校舍毁于战火，辗转四川合川艰难维续水产教育。1939年先于国立第二中学成立水产部，后于1943年成立国立四川水产职业学校。1947年在 上海市 复校，定名为上海市立 吴淞水产专科学校 ，1951年更名为上海水产专科学校，1952年组建升格为上海水产学院，成为中国第一所本科建制的高等水产学府。1972年受“文革”影响搬迁到 集美大桥 办学，更名为 集美大学水产学院 ，1979年迁回上海原址恢复上海水产学院，同时保留厦门水产学院。1985年11月，经农牧渔业部批准，更名为上海水产大学，隶属农牧渔业部（1988年更名为农业部）。2000年起，学校由农业部划转地方，由中央和地方共建，以 上海市 管理为主。2008年3月，为适应国家海洋事业发展需要，经教育部批准，更名为 上海海洋大学 。2010年，国家海洋局与上海市人民政府协议共建上海海洋大学。2011年，上海市人民政府与农业部（现农业农村部）联合发文共建上海海洋大学。
大连水产学院
大连水产学院 （现 大连海洋大学 ）是我国 北方地区 一所以海洋和水产学科为特色，农、工、理、管、文、法、经、艺等学科协调发展的多科性高等院校。学校创建于1952年，前身为东北水产技术学校，1958年升格为大连水产专科学校，1978年升格为大连水产学院。2000年由农业部划转 辽宁省 管理。2010年经教育部批准更名为大连海洋大学。
湛江水产学院
湛江水产学院（现 广东海洋大学 ）学校的前身是创建于1935年的 广东省水产学校 。她是 广东省 现代海洋水产教育的发端，几经迁徙之后升格发展成农业部直属的湛江水产学院。1997年1月，湛江水产学院和 湛江农业专科学校 实质性合并组建 湛江海洋大学 。2001年12月，湛江气象学校并入，2005年6月，经教育部批准，更名为广东海洋大学。
浙江水产学院
浙江水产学院 （现 浙江海洋大学 ）坐落在 舟山群岛 沈家门渔港。创建于1958年。原名“舟山水产学院”。1959年并入浙江农学院（现合并为 浙江大学 ），浙江农业大学成立后，该院易名为“浙江农业大学水产学院”，并将省海洋水产研究所和省淡水水产研究所归属水产学院。1962年2月又与浙江农业大学分离，单独办学。1975年8月更名为“浙江水产学院”。1998年与 舟山师范专科学校 合并组建为 浙江海洋学院 ，2016年更名 浙江海洋大学
厦门水产学院
厦门市 水产学院 （现 集美大学水产学院 ），系1972年上海水产学院南迁厦门而成立。1979年，经国务院批准，恢复上海水产学院和续办厦门水产学院，学院一分为二，两院于1979年12月起，各自独立办学。1994年10月，集美学村原五所高校合并成立 集美大学 ，厦门水产学院也并入集美大学，更名为集美大学水产学院。
山东海洋学院
山东海洋学院 水产系（现 中国海洋大学水产学院 ），创建于1946年，其前身为国立山东大学水产系，是国内最早的水产学科本科教育学科点，涵盖 水产养殖学 、 渔业 资源学和捕捞学3个二级国家重点学科及增养殖工程、渔业经济与管理、水产动物营养与饲料和水产 兽医学 4个自主设置二级学科。学院为国内首个硕士学位（1984）和博士学位授权点（1986），同时也是国内第一个水产学博士后流动站（1999）和首个博士学位授权一级学科点（2000）
华中农学院
华中农学院水产系(现 华中农业大学水产学院 )创建于1970年10月，是全国农业高校中首个成立的水产系，1972开始正式招生。1993年11月18日经国家农业部批准撤系建院，学院1978年开始招收本科生，1984年开始招收硕士生，1997年开始招收博土研究生，现有本科- 硕士 博士相衔接、完整的水产学科体系。
天津农学院
水产系的前身是创办于1910年的直隶水产讲习所，后更名为 河北省 立水产专科学校，1952年河北省水产专科学校改建为塘沽水产学校，1958年升格为 天津水产学院 ，1965年撤销。天津水产学院改建为天津水产学校、 天津市 经济管理学校，后并入 天津农学院 。