牡丹江市人民政府是牡丹江市的国家行政机关，是牡丹江市 人民代表大会 的执行机关，对牡丹江市人民代表大会和 黑龙江省人民政府 负责并报告工作，在牡丹江市人民代表大会闭幕期间，向牡丹江市人民代表大会常务委员会负责并报告工作。现任市长是杨勇。
职权范围
（一）执行本级人民代表大会及其常务委员会的决议，以及上级国家行政机关的决定和命令，规定行政措施，发布决定和命令；
（二）领导所属各 工作部门 和下级人民政府的工作；
（三）改变或者撤销所属各工作部门的不适当的命令、指示和下级人民政府的不适当的决定、命令；
（四）依照法律的规定任免、培训、考核和奖惩国家行政机关工作人员；
（五）编制和执行国民经济和社会发展规划纲要、计划和预算，管理本行政区域内的经济、教育、科学、文化、卫生、体育、城乡建设等事业和生态环境保护、自然资源、财政、民政、 社会保障 、公安、民族事务、司法行政、 中华人民共和国人口与计划生育法 等行政工作；
（六）保护 社会主义 的全民所有的财产和劳动群众集体所有的财产，保护公民私人所有的合法财产，维护社会秩序，保障公民的人身权利、民主权利和其他权利；
（七）履行国有资产管理职责；
（八）保护各种经济组织的合法权益；
（九）铸牢中华民族共同体意识，促进各民族广泛交往交流交融，保障少数民族的合法权利和利益，保障少数民族保持或者改革自己的风俗习惯的自由，帮助本行政区域内的民族自治地方依照宪法和法律实行区域自治，帮助各少数民族发展政治、经济和文化的建设事业；
（十）保障宪法和法律赋予妇女的男女平等、 同工同酬 和婚姻自由等各项权利；
（十一）办理上级国家行政机关交办的其他事项。
辖区概况
牡丹江市 辖 6 县（市）4 城区，总面积 3.88 万平方公里、人口 229 万人。该市沿边近海、区位优越，是全国重要的沿边开放城市和 黑龙江省 东南部区域中心，是 “一带一路”“中蒙俄经济走廊” 的重要战略支点，G10、G11 两条国道贯穿全境，滨绥、 图佳铁路 ， 哈牡高速铁路 、 牡绥铁路 、 牡佳高速铁路 在此交汇。
机构设置
市人民政府办公室
市发展和改革委员会
市教育局
市科学技术局
市工业和信息化局
市公安局
市民政局
市司法局
市 人力资源 和社会保障局
市自然资源局
市生态环境局
市住房和城乡 建设局
市 交通运输 局
市水务局
市农业农村局
市商务局
市文体广电和旅游局
市卫生健康委员会
市退役军人事务局
市应急管理局
市 审计局
市人民政府外事办公室
市市场监督管理局
市 信访局
市 统计暨普查局
市医疗保障局
市营商环境建设监督局
市林业和草原局
市人民政府研究室
市国防动员办公室
市经济合作促进局
市综合行政执法管理局
市数据局
黑龙江省 镜泊湖管理委员会
经济技术开发区管理委员会
市 供销合作社联合社
市气象局
市公共资源交易中心
市烟草专卖局