《中国医学科学院学报》创刊于1979年2月，是由中华人民共和国卫生部主管，中国医学科学院、 北京协和医学院 主办的中国国内外公开发行的综合性医学学术性期刊。
办刊历史
1979年2月，为了及时报道中国医学科学院医药卫生 科技人员 在科学研究、疾病防治等方面的成果和经验，提高医科院医药卫生工作水平，加强中国国内外的学术交流，经 中华人民共和国国家科学技术委员会 批准，创办了《中国医学科学院学报》。
1980年，从第3期开始，《中国医学科学院学报》开始在中国国内外公开发行。
1982年，为适应院校科研成果快速增长的需要，《中国医学科学院学报》改为双月刊。
1982年，为体现院校合一的管理体制，从第4期开始将《中国医学科学院学报》主办单位由中国医学科学院改为中国医学科学院、中国 首都医科大学 。
1984年，《中国医学科学院学报》封面改为网纹米黄色，中文刊名改用长体美术字；正文改用80克胶版，并增至80页。
1985年，随着 北京协和医学院－清华大学医学部 复名，《中国医学科学院学报》改为中国医学科学院、中国协和医科大学主办。
1988年，为保证学报质量，并加强责任制，从第4期开始刊登责任编辑姓名。同年，为进一步提高学报的学术水平，促进院校科研工作的发展，以适应开放和竞争的需要，《中国医学科学院学报》开始向中国国内外开放，吸收院校外具有重要创新和重大科研成果的论文在学报发表。
2014年12月，该刊成为 中国国家新闻出版广电总局 第一批认定 学术期刊 。
办刊条件
栏目方向
• 刊登内容
《中国医学科学院学报》主要报道中国在医学科学领域的最新研究成果，刊登具有中国国内外先进水平的 基础医学 、 临床医学 、 预防医学 、 生物医学 、 药学 及与医学有关的边缘学科的高水平、高质量的科研论文。
• 主要栏目
《中国医学科学院学报》主要设有院士论坛/述评、专家论坛/述评、论著、综述、技术方法、经验交流、研究简报、论著摘要、病例报告、科技消息、书评等栏目。
• 读者对象
《中国医学科学院学报》主要读者对象为中国全国高等医学院校、卫生系统科研、教学及医疗单位相关人员，中国国外生物医学领域专家、学者。
人员编制
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》第四届编辑委员会共有编委28人、顾问7人。
办刊成果
出版发行
据2018年11月16日 中国知网 显示，《中国医学科学院学报》出版文献共6359篇。
据2018年11月16日 万方数据 知识服务平台显示，《中国医学科学院学报》载文量为3267篇。
影响因子
据2018年11月16日中国知网显示，《中国医学科学院学报》总被下载681313次、总被引44971次；（2018版）复合影响因子为1.350、（2018版）综合影响因子为1.026 。
据2018年11月16日 万方数据股份有限公司 知识服务平台显示，《中国医学科学院学报》被引量为26049、下载量为232708；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国医学科学院学报》影响因子为1.496，在全部统计源期刊（6735种）中排第419名。
收录情况
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》被 美国 生物医学 文献联机数据库 美国国家医学图书馆 （PubMed、网络版）、 荷兰 医学文摘数据库（EMBASE）、美国 化学文摘 数据库及其《化学文摘》（CA）、 世界卫生组织 西 太平洋 地区医学索引（WPRIM）、世界卫生组织《医学增补文摘》光盘数据库（ExtraMED）、 波兰 《 哥白尼索引 》（IC）、日本科学技术振兴机构中国文献数据库（JST）、美国《乌利希期刊指南》（UPD）和美国 EBSCO 学术期刊 集成全文数据库（ EBSCO- ASP）、中国科学引文数据库（ 中国科学院图书馆 ）、中文核心期刊要目总览（1992年第一版、1996年第二版、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）（ 北京大学图书馆 ）、中国科技论文统计源数据库（ 中国科学技术信息研究所 ）、中国科技期刊论文与引文数据库（中国科学技术信息研究所）、 万方数据股份有限公司 资源系统数字化期刊群（中国科学技术信息研究所）、中国学术期刊综合评价数据库（中国科学文献计量评价研究中心）、中国学术期刊网络出版总库（中国学术期刊（光盘版）电子杂志社）、中国 生物医学 文献数据库（CBM、 中国医学科学院医学信息研究所 ）、中文生物医学期刊文献数据库（ 中国人民解放军医学图书馆 ）、中文科技期刊数据库（科学技术部西南 中国专利信息中心 ）、中国 生物学 文献数据库及其《 中国生物学文摘 》和《中国医学文摘》收录。
荣誉表彰
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》是中国科技核心期刊、医药卫生类核心期刊。
2001年，入选“中国期刊方阵－双百期刊”。
2004年，获得“第三届 国家期刊奖 百种重点期刊”及卫计委“首届医药卫生优秀期刊评比 一等奖 ”。
2008年，获得教育部“第二届中国高校精品科技期刊奖”。
2008、2011、2014年，连续三届被科技部“精品科技期刊服务与保障系统项目”评选为“中国精品科技期刊”。
2015年，被 国家新闻出版广电总局 推荐为“百强报刊” 。
文化传统
• 办刊宗旨
《中国医学科学院学报》旨在促进医学信息交流，提高医学学术水平。