在 植物学 里，胚轴 又称 胚茎，是胚的一个部分，为连接 小麦胚芽 与胚根的过渡部；胚轴要在种子发芽后，才伸长而变明显。胚轴以 子叶 作为分界，位于子叶着生点以上的部分称为上胚轴（ 英语 ：epicotyl），位于子叶着生点以下的部分称为下胚轴（英语：hypocotyl）。
简介
植物胚在发芽的过程中，胚根向下生长至土壤之中。在胚根发育之后，在胚根之上的胚轴是初始支撑子叶的构造，后续会发育成茎的一小部分。（大部分的茎由胚芽发育而成）。
在一些植物里，胚轴可作为储藏养分的器官，例如 仙客来 和 大岩桐 。
另有学者定义胚轴为 小麦胚芽 、上胚轴、下胚轴、胚根的合称。