《 古今图书集成 》是中国最大的一部 类书 ．
医学部分为《 医部全录 》。此书是《古今图书集成》中的一个部分，这是一部由清政府组织编写的大型综合性书籍，医学部分内容极为丰富。其取材广泛，既有中国医药学的基础理论，又包括了中医临床各科疾病的证治，上采 秦汉 医经及注释，下集近代名著及文献，堪称为医学百科全书。
概述
《医部全录》原隶此书“博物汇编、艺术典”下之“医部汇考”，共520卷，分类辑录自《 黄帝内经 》至 清代 120余种 医学文献 ，有古典医籍的注释，各种疾病的 辨证论治 ，医学艺术，记事及医家传略等，记述系统，分门别类明确，各科证治有论有方，引证材科均一一详注出处，标明书目、篇目和作者，便于查对原书，是一部比较全面的医学文献 参考书 。
印刷版本
此书清末有影印本、铅印本，1934年中华书局出版 缩印本 。
1962年， 人民卫生出版社 将《医部全录》排印分成十二册出版，订为医经注释，脉诊，外诊法， 脏腑 身形，诸疾，外科， 妇科学 ， 小儿科 ，总论及 列传 。艺文、纪事、杂论、外编等(共八个部分)。但将其中“ 太素脉诀 ”，“产图”等予以删去，对研究者为一缺憾。
本书内容详略
《 医部全录 》共 520卷，约950 万言 。
第1到70卷
为医经注释。
内容包括对《灵枢》《素问》《难经》三部经典的注释。其中
对《灵枢》的注释，采用了明代马元台全文注释的《 黄帝内经灵枢注证发微 》， 清代 张志聪 注解的《 黄帝内经灵枢集注 》两家注文；
对《素问》的注释，则采纳了 唐朝 王冰 重新编次并注释的《 黄帝内经素问 》，明代马元台注释的《 黄帝内经素问注证发微 》，清代张志聪注释的《 黄帝内经素问集注 》三家之注；
对《难经》的注释，仅取元代 滑寿 注释的《 难经本义 》一家注文。诸家注释辞达理明，析其精微，探其隐 ，钩其玄要，辨疑正误，颇得岐黄越人之旨趣。
第71到216卷
为脉法、外诊法、 脏腑 身形等内容。
其中“脉法”和“外诊法”，摘取了30余种医学书籍中有关四诊的论述。望、闻、问、切四诊合参，临床诊断疾病要结合患者的不同年龄、性别、体型、禀赋、动静等情况；望诊、切诊要因时、因地、因人而宜。词简意明，描述生动，辨析精详，切合实用。对“脏腑身形”内容，共博采了50多种重要医学名著的有关资料，详细载述了脏腑学说、 经络 学说，运气理论、身形理论，详细阐发了中医基础理论的精华内容。
第217到500卷
为临床各科疾病的证治。其中
“诸疾”为内科常见病证，收辑了古代医书中有关52种内科常见疾病证治的资料，一一做了论述。
外科部分，多取材於元代窦汉卿的《 疮疡经验全书 》、元代 齐德之 的《 外科精义 》、明代 王肯堂 的《疡医证治准绳》、 陈实功 的《 外科正宗 》、 楼英 的《 医学纲目 》等书内容。列 痈疽 毒、附骨 流注 、游风 丹毒 、 疡癜风、浸淫 癣等11门；
妇科学 部分，所辑录的文献资料，多取材於妇科名著，以月经、子嗣、胎前、临产、产后、崩漏等分门别类，详尽论述；
小儿科 部分，内容最为丰富，用100卷之多，分两大部分详细地作了载述，前半部对小儿一般常见病证列52门，分别进行阐释，包括胎养、初生护养、诊断以及各种疾病的治疗；后半部痘疹专论，详尽地叙述了中医对天花、 麻疹 的治疗经验。在其所选载的文献资料，有一部分录自现已少见的古代儿科著作。
第500至520卷
设总论、 列传 、艺文、纪事、杂录、外编等内容。
“总论”从《 周易风水 》、《 周礼 》及《灵枢》、《 素问 》等经典著作中摘录了某些有关医学的概论性资料；“医界名流列传”收辑了 清代 以前历代著名医学家的 传记 一千多例；
“艺文”是历代医药书籍中有研究价值的序和一些医学家的诗文；
“纪事”是历史书、笔记中有关中国传统医药的记事；
“杂论”是有关书籍中记载的医学事迹和寓言故事；
“外编”是非医学书籍中所记载的有关医学传说等内容。
《古今图书集成·医部全录》辑录了从 春秋战国 到 清朝 初期的医学著作百余种，分门别类归纳集成。其结构严谨，层次分明，载述有据，论理精详。此书对於医籍整理和医学整部著述的集成，在中医学术的发展上起到了积极的作用，有医学百科全书之称。