眼子菜科（学名：Potamogetonaceae），也被称为 藻类 科，是单子叶植物纲 泽泻亚纲 的一科。这是一种水生的单子叶开花植物科，包括约110种已知物种，分布在六个属中。眼子菜科的植物广泛分布在全球，作为水生动物的食物和 栖息地 ，被认为是水生环境中最重要的 被子植物门 群体之一。
形态特征
眼子菜科的植物都是水生 多年生草本 植物，常有匍匐的根茎和叶状的枝条。他们的叶片可以是漂浮的，也可以是水下的，他们的茎经常是相连的。叶子上没有气孔。花是四合花：花的公式（萼片；花瓣； 雄蕊 ；心皮）是[4;0;4;4]。花没有花瓣。果实由一到四个 核果 或 瘦果 组成。
代表植物
眼子菜 （ 眼子菜属 octandrus Poir）是眼子菜科的代表植物，为多年生水生 草本植物 。广泛地成片分布在中国各地湖泊中， 朝鲜 和 日本 也有分布，为稻田有害杂草之一。
分类研究
眼子菜科在克朗奎斯特分类法中被分到 茨藻 目中，但在1998年的APG 分类法和2003年经过修订的APG II 分类法中被分到 泽泻目 ，同时合并了原来的 角果藻科 ，但排除了 川蔓藻属 的植物品种。包括大约几十种水生植物，有漂浮的也有沉水的。
种属分布
本科10属，约170种。我国产8属，45种。
下级分类
二药藻 属 二药 Endl. 、 虾海藻属 Phyllospadix Hook. 、波喜荡属 Posidonia Konig. 、 眼子菜属 Potamogeton Linn. 、川蔓藻属 Ruppia Linn. 、针叶藻属 Syringodium Kutz. 、水麦冬属 Triglochin Linn. 、 大叶藻属 Zostera Linn.