石河子大学医学院前身是中国人民解放军第一兵团卫生学校。1949年8月1日，人民解放军第一野战军解放了甘肃天水，第一兵团在此办学校、办医院。同年9月25日，卫校师生在 兰州市 女子中学举行开学典礼，宣布第一兵团卫生学校正式成立。1949年10月16日，组建成立新疆军区卫生学校。1954年10月改名为 生产建设兵团 卫生学校，1959年12月又更名为兵团医学专科学校。1966年2月，更名为兵团医学院。1978年10月26日，正式命名为石河子医学院。
学院开设 临床医学 、 护理学 、预防医学、 口腔医学 、 医学影像学 、 医学检验技术 、 康复治疗学 和健康服务与管理8个本科专业。学院拥有8所 附属医院 （直属附属医院1所，非直属附属医院7所），14所教学、实习医院，其中 三级甲等医院 13所，以及5个 公共卫生 教学实习基地。
根据学院2024年2月29日官网数据显示，学院现有教职工2722人（院本部237人，临床师资2480人），其中专任教师169人，具有博士学位教师111人，高职称教师419人。拥有各类国家级人才称号7人，省部级人才称号38人，享受政府特殊津贴专家39人。荣获“宝钢优秀教师奖”2人，“全国优秀科技工作者”及“十佳全国优秀科技工作者 提名奖 ”2人，博士生导师28人，硕士生导师325人。学院现有全日制在校本科生3373人，硕士研究生1020人， 塔里木大学 分院558人，留学生389人。
石河子大学医学院现有5个“ 中西部高校综合实力提升工程 ”学科建设项目，5个省级重点学科，建成了“新疆地方与民族高发病教育部重点实验室”，成功获批国际科技合作基地、5个省级研究中心，与 北京大学 心血研究所联合挂牌成立心血管研究基地。 截至2025年5月，学院拥有一级学科博士学位授权点1个；一级学科硕士学位授权点4个；专业学位授权类别5个。
历史沿革
1949年8月1日，人民解放军第一野战军解放了甘肃天水，第一兵团司令员王震指示卫生部长 潘世征 办学校、办医院，在天水火车西站成立了第一兵团卫生学校筹备委员会，就地开展招生组建工作。10月16日，全校师生奉命 进军新疆 ，行军到达 哈密 、 吐鲁番 后，根据兵团指示分南北两路进疆，南路由王逐北率领二、四大队由吐鲁番步行43天到达 喀什 ，建立了南疆医训队。北路由政委李国清率领一、三大队，由哈密改乘 苏联 军用飞机 到达 迪化 。一、三大队360名学员、24名教学工勤人员，与原 联勤 总部驻新疆卫生人员训练组46人合并，组建成立新疆军区卫生学校。
1950年1月19日，卫校教工三百余人，全部到达新疆迪化，驻东门外大营房。第一兵团卫校进疆后改为新疆军区卫生学校。
1952年4月25日，新疆军区卫生部助产学校下马，其低年级学生130人编入卫校，成立护士班。
1954年8月12日，根据军区生产管理部通知，学校由东门外迁往老满城新址。10月， 新疆生产建设兵团 成立，卫校划归兵团，更名“新疆军区生产建设兵团卫生学校”。
1958年5月27日，学校全离开 乌鲁木齐市 搬迁至 石河子市 。
1959年8月，学校正式列入国家统一分配招生计划，并指定在 四川省 、 河南省 招收本科学生。12月，兵团卫生学校扩升为新疆军区生产建设兵团医学专科学校。
1970年2月，学校为师级单位，隶属兵团后勤部，全称“中国人民解放军 新疆军区生产建设兵团 医学专科学校”。5月，新疆军区生产建设兵团撤消，学校改名为“石河子医学专科学校”，归自治区教育局管理。
1975年8月25日，学校由医学专科学校升格为医学院，正式命名为“ 石河子医学院 ”。
1976年，兵团第二医院护士学校更名为“石河子医学院护士学校”。
1978年10月26日，遵照教育部的批示正式命名为石河子医学院。
1996年9月11日，农业部部属的 石河子大学 与石河子医学院、兵团经济专科学校、兵团师范专科学校合并组建成立 石河子大学 。
办学条件
院系概况
专业设置
石河子大学医学院设有基础医学系、护理系、 预防医学 系和 临床医学 系、 口腔医学 系、 医学影像学 系、医学检验系、 麻醉学 系等8个系，开设临床医学、 护理学 、预防医学、口腔医学、医学影像学、医学检验等6个本科专业，其中临床医学为大学特色专业，并在临床医学专业基础上开设诊断 病理学 、麻醉学等本科专业方向，设有临床医学、护理学、医学影像学、 临床检验学 、口腔、卫生事业管理6个专科专业。自1998年以来，病理学与病理 生理学 、 生物化学 与 分子生物学 、人体解剖学与组织胚胎学、生理学、免疫学、护理学、 流行病学 与卫生统计学、社会医学与卫生事业管理、外科学、 内科学 、 肿瘤学 、妇产科学、 眼科学 、 麻醉学 等14个硕士学位授予点陆续面向全国招收硕士研究生。学院现有2门自治区级精品课程，3门兵团级精品课程，3个兵团级重点学科，14门大学一类课程，7个校级重点学科，2个自治区质控中心，1个教育部重点 实验室 新疆地方与民族高发病重点实验室。
师资队伍
学院师资力量雄厚，既有在学术上功底深厚、有较高知名度的学者、专家，也有在专业上颇有建树的青年学者。学院现有教授56人，副教授120人，讲师188人；博士52人，在读博士74人，硕士133人；硕士生导师316人，兼职博士生导师12人。国家级突出贡献中青年专家2人，享受国务院特殊津贴专家5人，自治区优秀专家1人。拥有 附属医院 4所（直属医院1所，非直属医院3所），教学、实习医院30所，其中 三级甲等医院 10所。学院 第一附属医院 为全国“百佳”医院。
科学研究
学院重视开展科学研究和学术交流，公开出版发行期刊《 农垦医学 》（双月刊）。“十五”期间，承担各级各类科研课题120余项，其中国家自然科学基金、国际合作项目和省部级重大科研项目30项，发表论文600余篇（SCI收录7篇），出版学术专著7部，获省部级科研奖励20项。
石河子大学医学院广泛开展对外交流与合作。2007年 省部共建 教育部重点 实验室- 新疆地方与民族高发病实验室通过专家评估，成为教育部重点实验室，并与 复旦大学 遗传工程国家重点实验室、美国 阿拉巴马州 大学分子医学实验室等建立了长期协作关系，力争成为兵团和自治区的医学研究与科研开发中心。2001年6月，国家教育部指定 北京大学 对口支援 石河子大学 。作为石河子大学的重点发展学院，我院也与 北京大学医学部 （原 北京医科大学 ）建立了全面协作关系。截至2012年，学院与美国阿拉巴马大学医学院、北京大学医学部、 华中科技大学 同济医学院、 上海第二医科大学 、 复旦大学上海医学院 、 武汉大学医学院 等国内外医科院校建立了校际交流合作关系。
在新世纪里，石河子大学医学院将抓住机遇，以培养“宽口径、厚基础、强能力、高素质”的高级卫生技术人才为目标，发挥 综合性大学 学科齐全、文理渗透、医工、文结合的优势，为促进边疆各族人民卫生事业的发展和国家西部大开发战略的顺利实施做出应有的贡献。
领导团队
闫卫华 ：党委书记、 石河子大学医学院第一附属医院 常务副院长
于磊 ：党委委员、副书记（试用期一年）
彭心宇 ：院长、教授、博士
李锋：副院长、教授、博士、博导
黄鹏：党委常务副书记高级政工师
慕晓玲：副院长、教授、博士、硕导
井明霞 ：副院长
童巧霞：副院长
获得荣誉
2021年7月，石河子大学医学院 病理学 系党支部被中共 新疆维吾尔自治区 委员会授予“新疆维吾尔自治区先进基层党组织”称号。