丛书名。 爱新觉罗·旻宁 中 济南市 学者 马国翰 辑，一百册，七百三十九卷，凡五百九十四种。是一部规模巨大的辑佚书，辑录唐以前已散亡的古籍，分经、史、子三编。其中经编最多，比较完备；史、子两编数量少而又 错疏漏无体例，为未经编定之稿。所辑大部分书皆为作序录，介绍作者、卷数、内容及流传情况，对了解佚书大有裨益。所辑佚书包含丰富的内容，为研究古代思想、学术、科技等方面，提供了大量资料，历来受到学术界的重视。传世刊本后附辑者自著《 目耕帖 》三十一卷。
书籍简介
清末 济南市 学者生前辑录编辑《 玉函山房辑佚书 》，该书辑佚书594种，为辑书史上的空前巨著，辑录之书均为唐以前已散亡的古籍，但因 马国翰 去世未能刊行。
1870年，在 丁宝桢 协助下，泺源书院从马国翰亲属处借出《 玉函山房辑佚书 》的书板，整理后分订一百册印刷行世。为后世学术研究提供了珍贵资料。
《玉函山房佚书》分经、史、子三编，七百多卷，辑佚书五百九十四种。附刊马国翰著《目耕帖》三十一卷。所辑书，每种均亲为之序，介绍该书散佚情形与辑佚来源。该书为学术研究提供了一定方便，受到较高评价。
清末 李慈铭 在其日记里谈及此书为“以《 古经解钩沉 》及张介侯《 二酉堂丛书 》等为蓝本，而博稽广搜，较之王氏《汉魏遗书》，详略远判”。然而以一人之力辑成如此洋洋巨制，有失审慎之处也是在所难免的。就古籍辑佚整理而言，《玉函山房辑佚书》仍不失为一部资料翔实的巨著。
匡源 《玉函山房辑佚书序》
《玉函山房辑佚书》凡五百八十余种，为卷六百有奇，吾乡马竹吾先生之所辑也。先生悯今世学者不见古籍，乃徧校唐以前诸儒撰述，其名氏篇第列于史志及他书可考者，广引博徵，自群经注疏、音义，旁及史传、类书，片辞只字，罔弗搜辑，分经、史、诸子为三编，又各因所得多少为卷，作序录以冠于篇。六百卷内，惟《经编》为稍全，《史编》则所得仅 八卷 ，《子编》自 儒家 、农家外俱无目，颠倒舛错，漫无条理。盖当时随编随刊，书未成而先生卒，故其体例未能画一也。余得其书，乃参校汉、隋、唐《志》，补为目录如次，因为之序曰：
昔 孔子 没而大道微， 汉兴 六艺，仅得于焚灭之余，学者各以闻见相授受，专立门户，各抱一经，历 东汉 、魏、晋，诸儒迭出其所为书，若传、注、笺、解、训、故之类，愈辨而愈不胜其繁焉。六经支流，衍为诸子，纷然肴乱，各自为书，虽究其所蔽，好恶乖方，然博识多闻，苟或一言可采，则君子犹存之而弗废也。
自汉时 刘歆 、 班固 录书，序六艺为九种，历代因之，史官列有《经籍》、《艺文》，大率叙其篇次存亡以备稽考。当隋、唐之世，古籍犹未尽湮，然唐人为诸经定义疏，仅存汉注，所兼采者南北数十家外，诸儒略存梗概而已。《隋志》修于唐初，所著录汉儒旧籍，视班书篇目十已亡其六七，其幸而存者 魏晋 诸子，卷数虽繁，然有其名而无其书者尤多也。盖自书遭秦火至隋，而已更五厄，及其后凋零磨灭，不可胜数，非夫笃信好学、深耆先圣之道者，岂能独为是旁搜远绍哉！
我朝文教昌明，远迈前代。 乾隆 时启秘书之馆，诏在事诸臣，即《 永乐大典 》中编辑世所未见书多至二百七十部，好古之士欣然向风，于是海内佚书稍稍复聚。百余年来，学者务为搜 ，如《 皇清经解 》中诸家所辑古义，彬彬乎称极盛焉！
竹吾先生家贫好学，自为秀才时，每见异书，手自抄录；及成 进士 ，为县令，廉 俸 所入，悉以购书，所积至五万七千余卷。簿书之暇，殚心搜讨，不遗余力；晚归林下，犹复矻矻孜孜， 辑无虚日，其津逮后学之心，可谓勤矣！先生没后，板归 章丘区 李氏，已有散失，稚玉驾部印行数十部，其书始显于世。既而求者日多，丁中丞稚 、文中丞质夫先后为补刊，其残缺若干篇，而有目无书者尚少四十余种；其散见各序中所谓已有著录者，如 陆希声 《 周易传 》、 刘向 《洪范五行传记》、 刘歆 《洪范五行传》、 卫宏 《尚文训旨》、 李轨 《尚书音》、孙 《春秋左氏传贾服异同略》、蒋济《郊邱议》、 干宝 《司徒仪注》、 杨泉 《物理论》凡九种，亦皆不存，为仍其目，以待后之博学君子 补焉。
先生自著书有《 目耕帖 》三十一卷，皆编辑经训时所札记，起《 周易 》至《 周官 》，以附是书之后。
版本
1、清光绪九年(1883)长沙 嬛馆刊本。
2、清光绪十年(1884)章邱李氏据马氏刊版重印本。
3、清光绪十年(1884)楚南书局刊本。
4、1990年， 上海古典文学出版社 据嫏嬛馆本影印出版，凡四册，前三册为《玉函山房辑佚书》，第四册为《目耕帖》。该本后附有辑佚书目书名及著者名索引，颇便使用。
5、2004年，上海古籍出版社出版《 续修四库全书 》，亦据嫏嬛馆本编入《子部·杂家类》，收入第1200-1205册。