实体化石指的是动植物的实体化石，这些化石数量众多，涵盖了动物的骨骼、牙齿、 甲壳亚门 、贝壳，以及植物的茎、叶、花、果实等多种类型。由于长时间埋藏于地下，实体化石的原始物质成分发生了变化，通常会与地下水中的钙、硅、 硫化物 等元素发生 化学 交换，从而形成了坚硬的实体。此外，某些动植物的残骸会在软泥上留下印记，随着时间推移，这些印记可能会成为印痕、铸模或薄膜痕迹。
形成条件
特殊案例
在特定环境下，生物遗体可以相对完好地保存而不发生明显变化。例如， 西伯利亚地区 冻土中发现了约2.5万年前的 猛犸象 化石，不仅骨骼完整，还保留了皮肤、毛发、血液和胃部的食物。波兰斯大卢尼的一个 沥青 湖中发现了约1万年前的 披毛犀 整体化石，这是已知最为完整的 脊椎动物 化石之一。在中国抚顺煤矿形成的煤层中含有丰富的 琥珀 ，其中常包含完好的蚊子、 蜜蜂属 和其他昆虫化石，以及 蜘蛛 化石。
常规情况
大多数生物化石仅保留了硬体部分，并且经历了不同程度的石化作用。