哲布尊丹巴呼图克图，简称哲布尊丹巴，是 漠北 蒙古藏传佛教 最大的 活佛 世系，属 格鲁派 ，于17世纪初形成，与 内蒙古自治区 的 章嘉呼图克图 并称为 蒙古族 地区两大活佛。
哲布尊丹巴世系的确立
十六世纪， 藏传佛教 格鲁派 传入 蒙古族 地区，到十七世纪中叶，已经广泛传播于大部分蒙古族地区。 喀尔喀蒙古族 汗王 派人赴藏，要求 西藏自治区 派高僧前去传播佛教。1614年（明 万历 四十二年）， 觉囊 派高僧 多罗那他 被外 蒙古高原 诸汗王迎请到 乌兰巴托 ，并被尊称为“哲布尊丹巴”。1634年（明 崇祯 七年），多罗那他在 库伦 去世。次年， 土谢图汗部 王妃生一子，被确认为多罗那他的转世，法号 曲卡·罗桑丹贝坚赞 ，立其为法王。 顺治 六年（1649），罗桑丹贝坚赞赴西藏学法。七年（1650），罗桑丹贝坚赞从四世 班禅喇嘛 罗桑·却吉坚赞 受戒，并觐见了 格鲁派 领袖五世 达赖喇嘛 阿旺罗桑嘉措 ，两人均要求其 改宗 ，作为正式承认其 活佛 地位的条件。在 固始汗 的扶植下，八年（1651），罗桑丹贝坚赞由 觉囊派 改宗格鲁派， 达赖 承认其为第一世哲布尊丹巴。从此开始了哲布尊丹巴活佛系统。
顺治 十四年（1657）， 曲卡·罗桑丹贝坚赞 回 蒙古高原 传法，驻 喀尔喀土谢图汗 部之 额尔德尼 召（ 光显寺 ），逐渐成为 蒙古高原 各部的宗教领袖。 康熙 二十七年（1688）， 青海喀尔喀部 受 准噶尔汗国 噶尔丹策零 的攻击，罗桑丹贝坚赞率 喀尔喀三汗 所属部众臣服于 清朝 。三十年（1691）， 爱新觉罗·玄烨 册封其为 呼图克图 大 喇嘛 ，统管蒙古喀尔喀部宗教事务。此后，按惯例，哲布尊丹巴 活佛 系统的传承需受到清朝皇帝的册封才具有效力。
近当代的情况
1911年10月， 辛亥革命 爆发，八世 哲布尊丹巴博克多格根 在 俄罗斯帝国 的支持下于12月28日宣布 外蒙古 独立，任 日光皇帝 “ 额真汗 ”， 改元共戴 。1915年，哲布尊丹巴取消独立，受 袁世凯 政府册封为 呼图克图汗 ，保持了自治王公的地位。1919年， 北洋政府 徐树铮 趁 十月革命 之后 俄罗斯帝国 内战之际，率军队进占 乌兰巴托 ，取消 外蒙古 自治。1921年， 蒙古人民革命党 在 苏联红军 的协助下击败 白俄 军队，夺取蒙古政权，7月10日哲布尊丹巴成为 立宪君主 。1924年，八世 哲布尊丹巴博克多格根 于库伦突然 圆寂 ，人民革命党政府（政权）宣布不再寻找 转世灵童 ，11月24日建立 蒙古 ，开始限制和控制 藏传佛教 信仰（立法禁止寻找转世）。该世系在外蒙古终结。
其后，在 土登嘉措 的主持下， 西藏自治区 僧侣在 藏区 秘密进行了寻找 哲布尊丹巴博克多格根 转世灵童 的仪式，在1936年确认 蒋巴南卓 （1932年11月10日出生于拉萨 大昭寺 附近）为哲布尊丹巴转世。
哲布尊丹巴世系表
一世： 哲布尊丹巴一世 （1635年―1723年）
二世： 哲布尊丹巴·罗布丹彬多密 （1724年―1757年）
三世： 哲布尊丹巴·伊什丹巴尼玛 （1758年―1773年）
四世： 哲布尊丹巴·罗布藏图巴坦旺舒克 （1775年―1813年）
五世： 哲布尊丹巴·罗布藏楚都木济克默特 （1815年―1842年）
六世： 哲 哲布尊丹巴·罗布藏巴勒垫丹拜佳木粲 （1842年―1848年）
七世： 哲布尊丹巴·凯珠布丹桑 （1850年―1869年）
八世： 哲布尊丹巴·博克多格根 （1869年―1924年）