马科， 西宁市 人，明崇祯时期将领，以偏裨平流寇积功至总兵。以敢战著称，仅次于 曹变蛟 。 北京 失陷后降于 李自成 ，大顺军失败后又投降 清朝 。
人物生平
崇祯 初即从李卑平流寇。
五年（1632）春，混天猴陷 宜君县 、 州，其夏攻 合水 。 马科 以参将追寇至甘泉山。七月破之 延水 关，斩首六百二余级。其地东限 黄河 ，贼溺死者无算，科部卒斩混天猴以献朝廷。
李卑 于七年（1634）春六月卒于官，科遂改隶属 洪承畴 麾下。
李自成欲入 四川省 ，科与曹变蛟败之，并穷追之至 潼关 ，参与 潼关南原之战 ，大破之，李自成以十八骑逃亡。旋任 山海关区 总兵，从洪承畴援 锦州市 ，科驻防 塔山 ，清将 爱新觉罗·济尔哈朗 率兵至城下列 红夷大炮 攻之，明军杀死佐领崔应泰，参领迈色，城坏二十馀丈，清军悉登，遂克塔山。
其后科与 王朴 等从海路溃归，法司准备定罪， 御史 郝晋 认为：六镇同罪，皆宜死， 吴三桂 实辽左主将，不战而逃，奈何反加提督？ 兵部尚书 陈新甲 覆议：请斩 王朴 ，勒令 马科 立下军令状，再失战机立斩不赦。
十五年（1642）清军取得 松锦之战 的胜利后再次入塞杀戮劫掠，科领兵拒敌被击败。
十六年（1643）领兵入卫 北京 ，帝赐宴 武英殿 ，命从大学生 吴甡 南征，后来没有实行。
十七年（1644）三月科跟从 李建泰 西征 李自成 ，无功。
北京失陷后投降了李自成，被封为怀仁伯。不久与投降的辽东巡抚 黎玉田 领兵一万远征 四川省 的 明朝 势力。
五月，科由 汉中市 入川攻陷 保宁 ，明朝川北副史项国 牺牲。攻陷 潼川 ，科说降 知州 陈君宠，君宠不屈，与两个儿子从容自尽死。
此时 张献忠 已经在成都称帝所以不能容忍大顺军的势力在 四川 ，所以他亲自领兵击败了马科，迫使大顺军退回了汉中。
弘光 元年（1645）正月，科与 贺珍 领兵至 褒城县 ，攻 大西军 于 广元市 ，大西军屠广元而走。张献忠命令刘进孝屠杀保宁，贺珍的部将严自明、郑天禄大肆劫掠保宁而回。
正月十二日，清军占领了 潼关县 清军击败 李自成 进入 西安市 ，科与贺珍、 白广恩 等人投降。
七月贺珍反正归明，十月进攻 马科 于 汉中市 ，科击退了贺珍并杀死了他的部将魏景龙。
后事不详。