禾柄锈菌是一种真菌，其性孢子器生长在植物叶子上方，聚集在一起。这种真菌广泛分布于世界各地。秆锈病是由 锈菌 引起的疾病，主要侵害谷类作物，如小麦、 大麦 和 黑麦 等。其中，小麦的秆锈病由名为“Ug99”的变种秆锈菌引起，这种病菌在非洲、 亚洲 和 中东 地区广泛传播，引起了严重的饥荒和内乱，对全球粮食安全构成了威胁。自20世纪50年代以来，人们已经培育出对秆锈病具有抗性的小麦品种，并且还开发出了有效的杀菌剂。然而，1999年发现了一种新的致病菌株TTKSK，对目前大多数小麦品种都没有抵抗力。这种病菌在非洲、亚洲和中东地区引起了大规模的疫情，对全球粮食安全构成了威胁。2016年，另一种致病菌株TTTTF在 西西里 爆发，表明这种疾病正在重新进入 欧洲 。综合 基因组 分析、植物病理学和气候数据，预示着秆锈病可能会重新出现在 英国 。
形态特征
不动精子 器生于叶上面，聚生，蜜黄色； 春孢子 器生于叶下面或果实上，杯状或短柱状，单生或聚生；春孢子近球形或椭圆形，16-23×15-19μ m，侧壁 1-1.5μm厚，顶部 5-9μm厚，无色，有细疣。
夏孢子堆常生于叶鞘和秆上，也生于叶两面，裸露， 肉桂 褐色 ，粉状；夏孢子长卵形或椭圆形，21-40×13-23μm，壁1.5-2μm厚，顶部常略增厚，有刺，淡黄色至金褐色，芽孔 4或5个，腰生。
冬孢子堆与夏孢子堆相同，黑褐色，条状，达10mm长，裸露，垫状；冬孢子矩圆-椭圆形或棍棒形，38-60×18-25μm，顶端圆或锥形，基部较窄，隔膜处稍缢缩，侧壁1.5μm 厚，顶部5-13μm厚，栗褐色，光滑，上 细胞 芽孔顶生，下细胞芽孔近隔膜；柄黄褐色，略与孢子等长，不脱落。
产地分布
中国分布： 黄芦木 Berberis amurensis Rupr.陕西：南五台山（08376，18884）， 太白山 （ 34204， 34205）； 青海省 ： 湟源县 （24506，34207，34208，34209）。
短穗小 Berberis brachystachys Ying 四川：铁布（48537）。
短柄小檗 Berberis brachypoda Maxim. 陕西：太白（56437）。
直穗小檗 Berberis dasystachya Maxim. 安徽：黄山（43175）；湖北： 神农架林区 （55422）。
首阳小檗 Berberis dielsiana Fedde 陕西： 太白山 （24507，34190）； 河南省 ： 嵩县 （04078）。
蓝果小檗 湖北小檗 Schneid. var. lanceifolia Ahrendt 四川： 二郎山森林公园 （48538）。
细梗小檗 Berberis gyalaica Ahrendt var. minuata Ahrendt 四川： 九寨沟县 （48539）。
巴东小檗 Berberis henryana Schneid. 安徽：黄山（43176）。
全缘小檗 Berberis integerrima Bunge 新疆：裕民（53000）。
猪刺 Berberis julianae Schneid. 贵州：贵阳（ 06902）。
勒康特氏小檗 Berberis lecomtei Schneid. 四川：下阿坝（48540）。
老随子 Berberis levis Franch 四川：灌县（ 15264）。
苍白小檗 Berberis pallens Franch. 云南：中甸（ 48541）。
细叶小檗 Berberis poiretii Schneid. 北京：妙峰山（24799，22290，22292）； 河北省 ： 小五台山 （22295）； 河南省 ： 栾川县 （22296，22297）。
粉叶小檗 Berberis pruinosa Franch. 云南：东川（00584，06903），澄江（00322），昆明（06901），宣威（06900）。
华西小檗 Berberis silva-taroucana Schneid. 四川：铁布（48546）。
庐山小檗 Berberis virgetorum Schneid. 浙江： 天目山 （43177）。
刺檗 Berberis vulgaris L. 四川：铁布（ 48545），下阿坝（48543）。
金花小檗 Berberis wilsonae Hemsl. 四川：理县（ 15265）。
小檗属 Berberis sp. 甘肃： 祁连山脉 （07398）； 宁夏回族自治区 ： 贺兰山 （55157）； 河南省 ： 卢氏县 （17837）； 四川省 ： 理县 （14489）， 都江堰市 （15264）， 峨眉山 （18885），贡嘎山（48550）； 云南省 ： 丽江市 （48552）， 香格里拉市 （48548）； 西藏自治区 ： 米林县 （ 46853）。 墨脱县 （46850），波密（46851）。
十大功劳 十大功劳属 fortunei（Lindl.）Fedde 四川： 峨眉山 （10925）。
芨草 Achnatherum splendens（Trin.）Nevski 青海： 茶卡 （25539）。
冰草 冰草属 cristalum（L.）Gaertn. 青海：祁连（24505，24517）。
少花冰草 Agropyron pauciflorum Hitche. 北京：植物园（20565）。
粗茎冰草 Agropyron trachycaulum Link 北京：植物园（20566，20567）。
狭梗冰草 Agropyron trophorum Richt. 北京：植物园（20568）。
冰草属 冰草属 sp. 北京：植物园（20564），百花山（22326）； 河北省 ： 小五台山 （24806）， 承德市 （17798）； 山西省 ： 文水县 （17799）； 黑龙江省 ： 宁安市 （20560）。
巨序剪股颖 Agrostis gigantea Roth 新疆：巩留（ 54378）。
剪股颖属 Agrostis sp. 新疆：裕民（54379）。
窄颖赖草 Aneurolepidium angustum（Trin.） Nevski 新疆：裕民（53005）。
赖草 Aneurolepidium dasystachys（Trin.）Nevski 新疆： 乌鲁木齐市 （34200）。
莜麦 Avena nuda L. 河北：张北（17832）。
燕麦 燕麦属 sativa L. 陕西：零县（34193）； 甘肃省 ： 永登县 （04676）， 武威市 （17791，17835）。
燕麦属 Avena sp. 青海： 湟 源（17836）。
短柄草属 BrachyPodium sP．甘肃：舟曲（66991）。
旱雀麦 Bromus tectorum L. 青海：乐都（34202）。
雀麦属 Bromus sp. 江苏：南京（33057）； 西藏自治区 ：波密（45370）。
披碱草 Elymus dahuricus Turcz. 北京：植物园（ 20569）； 黑龙江省 ： 宁安市 （20570）， 铁力市 （17853）；西藏：波密（45371）。
老芒麦 Elymus sibiricus L. 北京：植物园（ 20626）； 山西省 ： 宁武县 （34199）；黑龙江：宁安（10571，20627，20629）。
披碱草属 Elymus sp. 北京：植物园（17838）； 浙江省 ： 浙江天目山 （43178）。
偃麦草 Elytrigia repens （L.）Desv. 新疆； 博格达山 （08378）， 塔城市 （53001）， 巩留县 （53003）。
堰麦草属 偃麦草属 sp. 北京：植物园（34197）。
野大麦 Hordeum brevisubulatum Link 北京：植物园（20630）； 内蒙古自治区 （34189）；辽宁兴城（18886）； 陕西省 ： 榆林市 （34188）。
毛 大麦草 Hordeum bogdanii Wilensky 新疆：塔城（53004）。
钝稃野大麦 Hordeum lagunculiforme Bakht. var. ithaburense（Boiss.）Nabel. 西藏：吉隆（62587）。
大麦 Hordeum vulgare L. 北京：（17841， 08381）；陕西： 营口市 （17840）； 甘肃省 ： 永登县 （04392）； 青海省 ： 湟源县 （24511）； 江苏省 ： 南京 （ 14485，14486，14487）； 浙江省 ： 余姚市 （14488）； 四川省 ： 康定市 （17839）； 云南省 ： 寻甸回族彝族自治县 （00607）， 普宁市 （ 01383），开远（01371）。
六棱大麦 Hordeum vulgare L. var. hexastichom Asch. 山西：汾阳（10405）。
毒麦 黑麦草属 temulentum L. 河南：洛阳（ 36575）。
纤毛鹅观草 Roegneria ciliaris（Trin.）Nevski 江苏：南京（10954）。
糙毛 鹅观草 Roegneria hirsuta Keng 青海：（ 34198）。
甘肃省 鹅观草 Roegneria kansuensis Keng 陕西：吴旗（34196）。
直穗鹅观草 Roegneria turczaninovii（Drobov） Nevski 黑龙江省 ：宁安（19590）。
鹅观草属 Roegneria sp. 山西：宁武（34195）； 吉林省 ： 公主岭市 （22325）； 陕西省 ： 太白山 （34203）； 甘肃 ： 榆中县 （34194）；新疆： 巩留县 （ 53008），塔尔巴哈台山（54187）； 西藏自治区 ：波密（45372，45373）。
黑麦 Secale cereale L. 河北：兴隆（34201）； 内蒙古自治区 ： 卓资县 （17844）；吉林：公主岭（35357）；陕西： 张良庙 （17843）； 甘肃省 ： 皋兰县 （ 10951）。
小麦 Triticum aestivum L. 北京：（14481， 17850）； 辽宁省 ： 沈阳市 （06935）； 黑龙江省 ： 宁安市 （14482），克山农场（08481）； 陕西省 ： 留坝县 （ 66971）；甘肃： 张掖市 （04657，24512，24810）， 临洮县 （04389），洮沙（04634）， 武威市 （04626）， 兰州市 （04397，04400）， 永登县 （04653）， 通渭县 （04614）； 青海省 ： 西宁市 （25542）， 湟源县 （17845）；新疆： 博格达山 （08380）， 莎车县 （31740）； 江苏省 ： 南京 （10953，14484）； 浙江省 ： 黄岩区 （13637， 13638）； 安徽 ： 埇桥区 （14477）； 江西省 ： 宁都县 （31743）， 余江区 （17846）； 福建省 ： 隆安 （31738， 31744）； 台湾 ： 台北市 （05020）， 花莲县 （05415）； 河南省 ： 信阳 （14478）；湖北： 武昌 （34214）； 广东省 ： 广州市 （00379，00381）； 四川省 ： 道孚县 （14847，14848，17849）， 都江堰市 （31741）， 青城山 （ 31742），通化（14439），威川（14475）； 云南省 ： 寻甸回族彝族自治县 （00598，00601，00609，00611，01334）， 宣威市 （ 00597），蒙自（01345），澄江（00380），昭通（00596，00606，00610），安宁（00603），东川（ 00599，00600），大理（31739）； 西藏自治区 ：波密（45374）。
世界分布：世界广布。
讨论
本种广布世界，寄主种类繁杂。 Eriksson（1894）设6个型。Gaeumann（1959）设5个型。Urban（1967）根据夏孢子长短分为2 亚种 ，即原 亚种 ssp. graminis和禾生亚种 ssp. graminicola，前者夏孢子较长，后者夏孢子较圆。Guyot et al.（1945-1946）根据夏孢子和冬孢子大小以及寄主范围设三个亚种，即ssp. minor、ssp. media和ssp. major。ssp. media下又设var. erikssoni、var. calamagrostidis、 var. lolii及var. vulpiae 4个变种， ssp. major 下又设 var. stakmani、var. tritici及 var. elymi 3个变种。Cummins（1971）采纳 Urban 的意见承认2个 亚种 。作者检查了来自全国各地的标本，也发现夏孢子的形状及大小变异较大，但难于划分明确的界限，因为大多数标本中不同大小的夏孢子往往混杂在一起。作者这里只承认一个复合种。庄剑云（1989）曾将新疆的标本划分为2个 亚种 ，这里暂不采纳。国内外关于此菌生理小种的研究已做大量工作，不加赘述。