戊辰战争，是日本历史上的内战。
1867年10月14日，当时的 幕府 将军 德川庆喜 在京都二条城宣布恢复 天皇氏 统治，将权力移交给天皇，阻止幕府被推翻。然而，缺乏治理政府能力的朝廷继续依赖 德川家族 ，即使在新政府中也有德川家族夺权的倾向。对此感到震惊的萨摩藩、 长州藩 与岩仓智美等反幕府贵族于12月9日发动 政变 ，旨在击败 江户幕府 势力，确立明治新政府。战争始于1868年1月27日，以萨、长两藩为主力的天皇军5000人，在京都附近与幕府军1.5万人激战（ 鸟羽、伏见之战 ），德川庆喜败走 江户城 ，标志着戊辰战争的开始。随后，天皇军大举东征，迫使 德川庆喜 于1868年5月3日交出江户城，并在11月初平定了 东北地区 的叛乱诸藩。1869年春，天皇军出征 北海道 ，于6月27日攻下 幕府 残余势力盘踞的最后据点 五棱郭 （在 函馆市 ），戊辰战争最终结束。
战争中的主要战役包括鸟羽伏见之战、 会津战争 和函馆战争。此后， 日本 由新政府统一，随着1871年7月14日废除封建领地、设立 都道府县 ，日本走上了中央集权国家的道路。
战争背景
1853年和1854年 美国 东印度 舰队司令 马休·佩里 （MathewPerry） 准将 率领舰队两度叩关 日本 （“ 黑船事件 ”），迫使幕府与美国签署了不平等的《日美亲善条约》（又称《 神奈川条约 》）， 江户幕府 两百余年的“锁国”政策宣告破产，欧美列强以 炮舰 为后盾打开了日本的国门，又凭借不平等条约规定的 殖民 权益，把日本变成了欧美近代大工业的原料供应地和销售市场， 日本 面临着和同时期其他 亚洲 国家一样沦为西方列强殖民地、半殖民地的厄运。接下来的十余年间， 日本 国内“佐幕”和“倒幕”势力进行了激烈的斗争，而德川幕府已经无力挽救民族危机，日渐成为日本近代化的障碍。
各方态度
即将爆发冲突之时，十五岁的 明治天皇 虽然冲龄，但已经表现出过人的智慧，受宫中人一致地信服。当时各方对形势的看法也各不一样： 法国 是明确拥护 幕府 。而 英国 支持萨、长两藩，如果幕府能与之合作更好，对 大政奉还 也赞成。 美国 荷兰 无意见。宫廷内的讨幕派以岩仓具视为中心，与 王政复古 派联合。王政复古派只要幕府肯在形式上奉还政权就已满足。佐幕派主张 公武合体 。亲幕派是则是 德川庆喜 的死党。亲法派主张强化幕府。 长州藩 力主反幕。萨摩藩反幕，但也赞成大政奉还。 土佐藩 、芸州藩、 宇和岛 藩及 越前 藩主张大政奉还，但也不反对反幕。 会津藩 拥护幕府。其中土佐藩主张 大政奉还 最坚决，土佐藩代表 山内丰信 的心腹 后藤象二郎 和 坂本龙马 共同提出了著名的《船中八策》（大政奉还案的原稿）。
大政奉还
大政奉还的呼声刚开始的时候， 庆喜 根据目前形势，知道各强藩正虎视 眈，伺机而动。对付 长州藩 已经很吃力，所以虚与委蛇，假意同意大政奉还，徐图再起，或者取实弃名，暂时放弃将军之名，以观后变。
山内提出的方案，远比庆喜想象的要缓和得多。这方案似乎只要 德川庆喜 做列藩会议的议长，其他对 幕府 的态度和要求似乎没有多大的改变。
英国 大使听到这消息以为从此幕府一切权限都转移到 天皇氏 ， 日本 将真正成为以朝廷为中心的国家。 法国 大使非常惊讶，立刻召集会议，研判的结果认为日本如果想要近代化，非将军莫属。
天皇密敕
大政奉还 案相当缓和，与讨幕派有很大的距离。坚持讨幕的只有 长州藩 ，其余的强藩都是两面赞成，但这时忽然出现了密敕——即天皇的诏书，文曰：
源庆喜，借累世之威，恃阖族之强，妄贼害之忠良，数弃绝王命，遂矫先帝之诏而不惧， 万民于沟壑而不顾，罪恶所至，神州将倾覆焉。朕今为民父母，是贼而不讨，何以上对先帝之灵，下报万民之深 哉。此朕之忧愤之所在，谅阖而不顾者，万不可以也。汝宜体朕之意，殄戮贼臣庆喜，以速奏回天之伟勋，而措生灵于山岳之安。此朕之愿，无敢或懈。
密敕 德川庆喜 的 大政奉还 的奏章同时到达，萨、长两藩暂时吧密敕收起，静观庆喜以后的动向。庆喜接到大政奉还案之后，本想以退为进，索性把将军的职位也辞掉。朝廷因此又将讨幕行动延期，各 公卿 很怕会打起仗来，决定召集十万石以上的诸藩主来京都开会。于是诸藩主中反幕派和拥幕派两方都调集大军，形成对峙局面。
导火索
1867年12月19日（阴历，下同），占据 京都 的倒幕派在15岁的 明治天皇 的支持下发动宫廷政变，实行“ 王政复古 ”，也就是天皇从幕府收回统治权，下令剥夺德川家的将军之职，废除幕府制度，紧接着要求德川将军“辞官纳地”即交出统治地区。
战争本来就是倒幕派所希望的夺权手段。 西乡隆盛 和 大久保利通 曾表示：“二百余年太平旧习污染了人心，一旦动起干戈，反使天下耳目一新，中原弥定，构成盛举。决然 一战 ，乃是死中求活的着眼点，最为紧要之务。”
但幕府不甘灭亡，1868年（农历戊辰年）1月1日， 江户幕府 发出《讨萨表》，以清君侧为名向倒幕派宣战，次日幕府军和佐幕各藩的军队便开始由 大阪 出发进军 京都 。鉴于兵力上的劣势，倒幕派依托京都采用战略防御态势。戊辰战争爆发了！
鸟羽伏见之战
倒幕军队
倒幕派军队的主力是 日本 西南部的萨摩藩和 长州藩 的部队。长州藩早就进行了军事改革，废除了以往作为藩兵基本编制的八组，建立了一支以 奇兵队 、集义队、游击队、 惩队等诸队为主力的 新建陆军 。奇兵队是 高杉晋作 以“聚集有志者，不论 藩士 、陪臣和轻卒，都同等对待”为口号建立的“平民军队”。市医出生熟谙西方近代军事知识的大村益次郎为了加强部队的战斗力，还积极进行了军事武器装备方面的改革，把落后的 火绳枪 等旧式武器卖掉，从 长崎市 的英商那里买到 法国 造 米涅步枪 四千三百支， 荷兰 造盖贝尔步枪三千支。1866年，萨摩藩模仿 英国 编制，组建了以小 队、城下队和外城队为主力的 新军 。和长州军一样，萨摩军也装备了从西方进口的新式枪炮。
但是，倒幕派面对的绝不是仅仅装备 武士刀 的对手， 幕府 在存亡危机的压力下也进行了军事改革。
幕府陆军
1862年12月， 江户幕府 发布了《兵赋令》。标志着幕府组建 新式陆军 的开始。《兵赋令》规定，“兵赋”自年龄十七岁到四十五岁、身强体壮的农民中间选拔，按领地的大小，以每五百石（石，米谷的 计量单位 ，也用于衡量领地大小）出一人，每一千石出三人、每三千石出十人的原则征募。幕府新式陆军组建时的步枪主要有盖贝尔式和恩菲尔德式两种，后者正在逐渐取代前者。在 大炮 方面，老式的前装 滑膛炮 仍占主流，但已经开始引进新型的 线膛炮 。1866年末代将军 德川庆喜 上台以后，聘请了 法国 的教官开始了法式陆军训练，组建了近万人的 新式陆军 。值得一提的是，法国教官第一次将 欧洲 的军事体操引入了 日本 。当时被称为“练体法”的军事体操的作用在于锻炼士兵们的体魄，使他们的身体状况可以适应训练和作战的需要。但是幕府军的军官始终由 世袭 的武士担任，使得幕府的军事改革仍未脱出封建制度的 臼，始终落后于萨、长。
战役开始
由于优势的幕府海军此时已经控制了日本的海运 大动脉 —— 濑户内海 的 制海权 。倒幕派只有力争大胜，夺取 大阪 这个 幕府 的陆海军基地，才能保障 京都 乃至整个关西的安全。如同西方军事家 卡尔·冯·克劳塞维茨 在《 战争论 上下 影响世界历史进程的书 》中所说：“主力会战，正像我们以后还要详细说明的那样，是最好的手段。谁害怕大的决战而逃避主力会战，通常谁就要自食其果”，双方在京 的战斗，既是戊辰战争的初战，同时也是决战。
1月2日下午，幕府军进据京都南十二公里左右的淀城（但最高统帅 德川庆喜 却一直远在后方 大坂 ）。随即分兵两路，主力东出伏见，由陆军奉行竹中重固指挥，率领幕府军及会津等藩兵及“ 新选组 ”等，兵力约八千人，当晚驻伏见奉行所。1868年1月3日（庆应3年12月9日），倒幕派在朝廷发起宣告将政权交归 天皇氏 的 政变 （ 大政奉还 ）。在 王政复古 中，新政府的 小御所会议 上，决定了要幕府将军德川庆喜向朝廷返还官位和领地（辞官纳地）。此事刺激了拥护 幕府 的 会津藩 、桑名藩的藩兵从 大坂 向 京都 进军，同以萨摩和长州两藩军队为主力的政府军在京都南郊的 鸟羽 、伏见发生冲突，即 鸟羽伏见之战 （ 日语 ：鸟羽・伏见の い）。
战役过程
倒幕军在鸟羽布置有一个半月形阵地，从东边的 中岛 到 鸭川 西岸的小枝，守军有萨摩兵二千及一部分长州兵。1月3日下午，幕府军要求守军让路并下令强行通过，萨摩守军首先开炮，第一发炮弹就击中幕军纵列顶部的一个炮兵队，随即又是雨点般的枪击，幕府军顿时大乱。后来幕府军好不容易才组织还击， 京都 的宪兵警察组织“见回组”还进行了白刃冲锋，但这些精于刀剑的武士立即被枪弹击退。入夜， 幕府 军无法抵御讨幕派的夜袭，遂连夜逃回淀城。
伏见在 鸟羽 之东，是京都南约六公里的一个小市镇，西滨贺茂川，东靠 桃山 。奉行所在它的东南角，由土墙和巨屋所圈围，在当时的火力条件下，算得上是一个牢固的堡垒。同鸟羽方面一样，官军也有一个半月形阵地，占据了桃山制高点，从三面包围着伏见奉行所。守军有长州兵一千八百人、萨摩兵一部和 土佐藩 的三百人。 幕府 军多次冲击倒幕派的阵地，曾一度占领桃山，后都被打退。入夜，倒幕派照样进行夜袭，到4日黎明，幕军被迫退回淀城。这样，幕军在鸟羽、伏见两个战场都遭受惨败。
战端一启，1月3日中午，朝廷便宣布 江户幕府 为“朝敌”决定讨伐。4日朝廷以 仁和寺 宫为征讨大将军，下令征讨 幕府 军。午后二时左右，仁和寺宫嘉璋亲王捧 天皇 御赐锦旗和节刀到达 东寺 的官军大营，倒幕军士气为之大振，乘胜展开追击。倒幕官军的实际最高指挥 西乡隆盛 欣喜地写道：“3日到6日，没有后退一步，没有一点失败，如此彻底大胜的军队实在未曾有过”。幕府军连战连败被迫退往 大阪 。
战役结果
鸟羽 、伏见战役惨败后，原先效忠 幕府 的各藩纷纷倒戈。幕府军败退后曾欲固守淀城，淀城藩是 江户幕府 的“ 谱代大名 ”（指 德川家康 奠定霸业前即臣服的诸侯，相当其嫡系），就在三天前还是幕府军的前线指挥部，但此时却断然拒绝幕府军入城，并开城欢迎倒幕官军。甚至“ 御三家 ”（和将军家有血缘关系，有权使用德川姓氏并在将军无嗣的情况下继承 幕府 ）之一的纪州藩也借“勤王”之名保持中立。真可谓大树将倾，众叛亲离！
大阪 久有“金城汤池”之称，又有“大坂富庶，雄于天下”之说。然而此时在 大坂 的幕府军最高统帅将军 德川庆喜 ，却已经丧失了战斗意志，于元月7日早晨抛下尚在战斗的军队，与幕府重要官员 松平容保 （ 会津藩 藩主）、松平定敬（桑名藩藩主）、 老中 （直属将军统辖政务的最高官职）板仓胜静等乘旗舰“开阳”号逃回 江户城 。 大阪城 中的 幕府 军闻讯后尽皆惊愕，遂作鸟兽散。海军副总裁 榎本武扬 只得将城中藏金十八万两搬上军舰，并接载部分伤兵驰向 江户 。8日， 长州藩 部队进入 大阪 ，宣告幕府军在 京畿 决战中的彻底失败。
幕府败因
幕府军在京畿战场上的失败，首要原因固然是政治上的倒行逆施不得人心， 平安京 一带的市民、商人和农民给了官军极大的支持。西乡记录道：幕府在“京摄之间，人心丧尽，……伏见一带，虽有兵火烧过，但每有萨（摩）长（州）兵队经过，“男女老少则出于路旁，合手礼拜，连声道谢。战场上也有送粮食，烧开水，酌酒犒劳战兵者。比本藩人民还要好些。”但幕府军在 军事战略 上的失误无疑也是重要原因，幕府军本可以直属部队为主力，沿 淀川 北上，直叩 京都 南门，另由称为“佐幕双璧”的悍勇的会津、桑名藩兵取道连接 江户 和京都的干线道路“中山道”，从关原( 琵琶湖 东北、1600年 德川家康 曾在此地获胜从而奠定 江户幕府 的霸业)和铃鹿 ，径向京都东边门户大津，两边夹击，逼倒幕派官军向西退却。但 幕府 军却以臃肿的队形，集全部人马出于淀川一路，态势凝重呆板。果然，战事失利后这种一窝蜂的进军便化作一窝蜂的溃退。
京畿战场胜利后， 天皇氏 于元月7日下达了“征讨庆喜令”，16日撤掉 德川庆喜 前 内大臣 职务，剥夺会津、桑名等顽固佐幕派的 领地 和官职，宣布将旧 幕府 领地列为朝廷领地。新政府为争取反幕势力，1月12日下令“幕府领地今年租税减半”，此举为新政府赢得了民众更多的支持。新政府为使天皇政权获得欧美各国的承认，1月15日派使者去 神户 ，向各国公使面交国书。其内容： 天皇 亲裁内外政事；过去条约称大君，今后改称天皇；承认旧 幕府 和外国所订条约；对内批判幕府的过错，对外采取开国友好方针。各国承认新政府和旧幕府为对等的交战团体，宣告战争中局外中立。但 法国 暗中支持幕府， 英国 商人则把大批武器卖给倒幕派。2月6日改 东海 、东山、北陆三道镇抚 总督 为先锋总督兼镇抚使，9日任命政府总裁 有栖川宫炽仁亲王 为东征大总督， 西乡隆盛 等人为参谋。倒幕派官军由西乡隆盛等指挥，在“万民欢呼之中”，从战略防御转入战略反攻。东征军以萨长兵为主力，号称5万军马，2月11日开始依次出发，15日 炽仁亲王 被 天皇氏 亲自授予锦旗、节刀踏上了征途。 长州藩 士 品川弥二郎 见其军威作俚谣广为流传。歌词曰：“亲王亲王御马前，随风飘扬的是何物？咚咚咚呀咧咚，君不知那是征伐朝敌的御锦旗？”东征的官军进展神速，2月，“佐幕双璧”之一的桑名藩不战而降。3月， 德川家族 发祥地三河亦落入官军之手。
江户开城
幕府分裂
德川庆喜 逃回 江户城 后，幕府内分裂成“恭顺派”和“主战派”。德川庆喜最后接受了恭顺派的主张，解雇了支持“主战派”争取 法国 援助进行决战主张的法国军事教官歇多万。任命 日本 近代海军的创始人，主张“绝对恭顺”的 胜海舟 为陆军总裁，主持幕府事务。
但“恭顺派”并不是准备 无条件投降 。他们不过是要以温和的手段来最大限度地保住幕府的利益。尽管幕府陆军的主力已经在鸟羽、伏见战役中被消灭，但胜海舟执政后即派出“甲州镇抚队”和“信州镇抚队”前往阻止官军东进。2月23日他将“甲州镇抚”的任务交给了曾在 京都 血腥镇压维新志士，和倒幕派誓不两立的“ 新选组 ”，提升“新选组”局长近藤勇为若年寄（官名）、副局长 土方岁三 为若合席（官名），拨给金五千两、 火炮 二门、枪五百支及其他军用物资；甲州即 甲府 ，在今甲斐城，地势险要，坂垣退助评论道:“中宽四塞，山河险峻，天下罕见其匹。”又任命古屋佐久卫门担任步兵头（官名），率第六联队，携炮四门及其他物资，出抚信州（信浓）。 胜海舟 还准备在和新政府的谈判失败后，就疏散 江户城 市民，火烧八百街，绝不交出完整的 江户城 。
进军甲信
3月1日， 幕府 的“甲州镇抚队”和官军的甲州支队同日向甲府进发，但官军抢先一天进入甲府。3月6日，官军兵分三路击溃了幕府军，控制了 甲州 。同时，官军的东进部队在豪商相乐总三组织的民间武装“ 赤报队 ”的帮助下于3月6日越过天险锥冰峠，3月10日黎明突袭幕府的信州镇抚队，1800人的幕府军逃往东北方的 会津藩 ，官军占领北部 关东平原 ，与南边的甲州支队相呼应，形成了对 江户城 的 钳形攻势 ，幕府军的防线被彻底击垮，官军预定3月15号总攻江户。
甲州、信州镇抚的失败，彻底打破了幕府主战派的一切幻想。3月14日， 幕府 的恭顺派终于和官军达成江户“无血开城”的协议，规定幕府交出军舰和一切武器， 德川庆喜 去 水户市 “谨慎”(实为幽禁)，让田安龟之助(后改名为 德川家达 )继承德川家，仍给静冈土地70万石。至此，统治 日本 260多年的 江户幕府 名实俱亡。4月21日，东征大 总督 有栖川宫炽仁亲王 进入 江户 ，把旧将军府改为大总督府。不久，这座将军的居城，将成为日本的新首都。不甘心失败的反动武士组织了一支拥有两千人的名为“ 彰义队 ”的反新政府武装，拥立轮王寺宫( 皇族 主持)以上野宽永寺为据点，串通德川幕府残余势力继续同明治政府为敌。5月15日，在上野之战中，彰义队被大村益次郎指挥的官军包围击溃。倒幕派的反攻取得了完全胜利。
民众支持
值得一提的是，倒幕派官军在东征时得到了各地人民的大力支持。特别是相乐总三组织的“ 赤报队 ”，进入关东为新政府军开辟道路，向农民宣传年贡减半的政策，在战争中为官军做出了极大贡献。但是明治政府战争未结束就决定食言，遂以冒充官军为罪名解散“赤报队”，并将 相乐总 三等首领处死。这暴露了明治政府反人民的局限性。
会津之战
列藩同盟
江户幕府 虽亡，但 内战 还没有结束。被列为“朝敌”的 会津藩 主 松平容保 自回会津以后，整备军火，改革兵制，准备和新政府军决一死战，会津一时成为反新政府势力的中心。 江户开城 以后，原 幕府 步兵奉行 大鸟圭介 就带领精兵2000从江户逃往会津藩。同时， 东北 （ 陆奥国 ，出羽、越后）地方诸藩并不希望把奥羽地方卷入战火中。4月11日， 仙台市 藩主伊达庆邦， 米泽 藩主上杉齐宪向奥羽镇抚 总督 九条道孝 提出对会津宽大处理的请求，但是遭到了拒绝。于是5月6日，以会津、庄内两藩为中心的东北各藩成立了“奥羽越列藩同盟”，发出“讨萨檄文”，扬言要清君侧和扫除“伪官军”。战火终于燃遍了整个 东北地区 。
血战长冈
大村益次郎在上野之战后，取代 西乡隆盛 担成了官军的最高指挥。他对付奥羽越同盟的战略思想是：“首先除去枝叶(指各藩)，茎干(指会津)自然干枯。”到6月，官军兵分三路进行讨伐。后来西乡隆盛担任了越后方面的海军 总督 。
白河位于古奥羽街道的北线起点，是通往奥羽，各地的重要关门。奥羽越同盟建立后，于5月26日对官军占领的白河进行了第一次大规模攻击。以后一直到7月15日，奥羽越同盟军共组织了七次进攻，即所谓白河七战，结果全部失败。官军始终控制着白河，从正面威胁着同盟，吸引并消耗了它的大量兵力。白河攻防战在 奥羽 越战争中具有重要意义。
长冈 是越后北部强藩，民风质朴强悍。藩主牧野忠信，为 德川家康 十七将之一的 牧野康成 之后。他曾在藩内改革兵制，设置军校，装备洋枪洋炮。 长冈 藩军事 总督 河井继之助早在归藩前就把江户藩邸内的古董和什器全部变卖，以所得款项从外国商人处重金购入了两门最新式的“加提林”自动速射铳炮（1862年由美国人加提林发明， 南北战争 期间曾使用过，在清朝被称为快炮又名十门连珠炮），这种威力强劲的武器当时在 日本 总共只有三门。5月初 长冈 吕振羽 官军谈判要求武装中立被拒绝，遂加入奥羽越同盟和官军作战。5月19日，官军攻克长冈。长冈城下町屋舍被焚毁达二千五百余间，兵学所、藩校 崇德 馆、社寺等重要设施也荡然无存。“数十年来所积之军用金二十万两， 火炮 四十门，武器弹药无算，尽被‘贼军’（指官军）掠走”。以后双方在长冈附近反复格斗，难解难分。7月初官军增兵达四万三千人，这里是整个奥羽越战争中投入兵力最多的一个地区。由于官军握有 制海权 ， 柏崎 、新 等港口很快被官军所控制。河井继之助为了避免长期消耗而寻求决战。7月24日，在 米泽 等藩兵的配合下，终于击败官军夺回 长冈 。随后，会津、 仙台市 等盟军先后开到，但河井身负重伤，盟军失去指挥，未能组织追击。官军于7月29日反攻夺回长冈，同盟军在越后北部彻底败北。长冈争夺战是奥羽越战争中最激烈的一个战役。长冈的二次失守，吹响了“奥羽越列藩同盟”灭亡的号角。属于列藩同盟的越后诸藩相继向新政府投降。
攻克会津
8月23日，坂垣退助的中路军抵达 会津若松市 城下，官军开始酝酿会津攻坚战。当时军中有两种战略，一是继续沿用“除支弱干”的办法，先征服 米泽 ，仙台；一是先攻会津，理由是如果米泽仙台久攻不下则战事势必拖延到冬季，这对以萨摩、长州等南方兵为主的官军很不利。于是官军决定采用“会津攻城，仙米攻心”的战略。
9月初，包围会津若松城的官军达到3万人。在 会津战争 中，由16、17岁会津藩士的子弟们组成的少年敢死队“ 白虎队 ”与官军的战斗失败后，从远处看到会津城起火，误以为会津城已失陷，于是19位少年队士在饭盛山集体剖腹自杀。从9月14日开始，官军发动总攻击。22日，最顽固的封建领主 松平容保 不得不开城投降。反政府势力的最强悍的一个据点被拔掉，在此前 米泽藩 和东北第一大藩仙台藩已经相继投降。官军在 本州岛 上确立了完全的统治。
8月的奥州会津战争是戊辰战争中最关键的一场战役。政府军3000人迂回突袭 会津藩 的若松城。战斗历经1个多月，9月22日会津藩开城投降。会津藩战死3000人，包括未成年的 少年白虎队 成员，此外还有许多人集体自杀。而政府军不允许安葬失败者尸体，只得任其腐烂，直到12月才允许埋葬，但是仍然不允许树碑题词。而会津藩也被迁移到斗南藩（今 青森县 ）。会津人则被称为“会贼”，居住地则被称为“白河以北一山百文”（意即一文不值的落后之地）。
占领虾夷
在 东北 战争激烈进行的时候，旧幕府海军总裁 榎本武扬 ，于江户率领“开阳”等八艘 幕府 残余军舰及仙台藩兵，与幕府 老中 板仓胜静等幕府遗臣，带领4000余人从品川湾逃脱，驶向 虾夷 （ 北海道 ）。10月12日强顶暴风雪登陆虾夷 木，随即南下 函馆市 ，击退官军箱馆 知事 清水谷公孝，11月攻陷松前福山城，和平接收 五棱郭 （坚固的西方式要塞，克服了旧式 日本 城池存在射击死角的缺陷），平定了虾夷南部。
本武扬等人占领虾夷之后玩弄两面手法。一方面表示承认明治政府为日本正统政府，请求把虾夷地作为德川家的静冈藩飞地，通过山野开拓使“信守忠臣不仕二主之义”的旧幕臣有安身立命之地；另一方面，12月15日， 榎本武扬 宣布成立“ 虾夷共和国 ”，大宴各国领事，从各国领事手里接过各国领事承认箱馆政权为事实上的政权的 备忘录 。并且在 五棱郭 布置大本营，以陆海军 士官 以上投票，选出榎\\本武扬为“虾夷共和国”总裁， 大鸟圭介 和 土方岁三 为陆军奉行、军事指导。以榎本武扬为首的首脑，主张征收比较高额的赋税，以集结军费整备军力与明治政府对抗并决一死战。而土方岁三认为武士死则死矣，能够为了信念死在战场上就已经足够光荣，不必再增加赋税增加百姓的负担。这种看法倒是颇有些英雄气概的。
“宜将剩勇追穷寇，不可沽名学霸王”，明治政府绝不容忍旧 幕府 势力继续存在下去。
海军北伐
新政府在加紧改革的同时，致力于全 日本 的统一，于翌年春暖，组织了 黑田清隆 率领的征讨军北伐 虾夷共和国 。
北海道 与 本州岛 隔海相望，海军力量对双方都有重要意义。官军方面的主力战舰是刚刚获得的“甲铁”舰，该舰是一艘 法国 造 铁甲舰 ，为木制船体外部覆盖厚度4.5英寸的铁制装甲，排水量1358吨、蒸汽/风帆混和动力、最高速度6～8节。船 炮廓安装1门阿姆斯特朗300磅炮，另有2门阿姆斯特朗70磅炮、2门 6磅炮 和2门4磅 山炮 ，此外舰艏还装有3.5米长度的冲角，而榎本海军和政府军的其他战舰都是木质军舰。榎\\本海军自从最强大的“开阳”号意外触礁沉没后，只剩“回天”、“蟠龙”、“ [{'segmentStyle': {'bold': False, 'fontSize': 10, 'foreColor': '#000000', 'italic': False, 'strikeThrough': False, 'underline': False}, 'text': '千代田装甲巡洋舰', 'type': 'text'}, {'segmentStyle': {'bold': False, 'fontSize': 10, 'foreColor': '#000000', 'italic': False, 'strikeThrough': False, 'underline': False}, 'text': '', 'type': 'text'}] ”三舰。但其中法国造“回天”舰吨位1678吨，炮13门，是双方参战军舰中最大、性能亦较优的舰只。
明治 二年（1869）春，日本政府军在 青森县 集结准备越过 津轻海峡 登陆 虾夷 。3月9日， 日本 舰队自品川海峡一路北上，进入了陆中的宫古湾。
尽管实力弱小，但榎本海军还是组织了一次奇袭。这当然是正确的，如同西方军事家 阿尔弗雷德·马汉 在《 海权论 》所认为的一样，海军的存在是为了进攻，防御只是进攻的准备，即使全局处于防御态势，海军舰队也必须积极出击，通过海上交战达到一定的结局。如果榎\\本海军组织得当，未必没有获胜的机会。但榎本的目标是夺取“甲铁”舰，而不是消灭政府海军主力而夺取 制海权 。3月25日，由于天气原因，到达宫古湾的只有“回天”一舰，悬挂着 美国 国旗的“回天”成功地潜入宫古湾，它立即降下美国旗、扬起太阳旗，使用56磅火炮对“甲铁”实施压制轰击，同时以舰艏抵上“甲铁”右舷。但是跳舷夺船的“新选组” 特别行动队 被 甲铁舰 上的官兵用密集火力击退，“回天”舰被迫败走。“回天”舰无力回天，制海权就此被政府海军牢固控制。
最后一战
4月4日，8000政府军开始在 渡岛半岛 西北 的乙部登陆。4月17日夺取半岛西南端要地松前，22日占领西北要地木古内。双方的舰只亦在海上反复交锋，5月初，“回天”号和“蟠龙”号被官军优势舰队打得搁浅。11日官军攻下箱馆，猛将 土方岁三 在激战中被击毙。官军随又包围榎本政权心脏之地 五棱郭 ，“甲铁”号开始对五棱郭的要塞进行炮击。穷途末路的 榎本武扬 见大势已去，准备自尽，为部下劝阻，于5月18日献城投降，短暂存在的“ 虾夷共和国 ”宣告灭亡。这是戊辰战争中官军追击东北残敌，夺取和巩固在全 日本 的胜利的最后一个战役。至此，历时一年半的 内战 ，以 江户幕府 及其残余势力的彻底失败、新政府的胜利而告终。
战争意义
这场内战把日本从腐朽落后的 幕府 封建统治下解放出来，为日本建立统一的近代国家奠定基础。就此，一个新生的 大日本帝国 ，开始出现在 亚洲 的东部。然而，依靠枪炮建立的明治政权不久就准备依靠枪炮，去实现“开拓万里波涛，布国威于四方”的野心了。