学院於一九三零年由 进士 陈焕章 博士与一群尊孔学者在 香港特别行政区 创立。八十年来在各任院长的领导下，以弘扬圣道，匡正人心，兴学办校，培育青年为职志，一本立己立人，树木树人之旨，夙夜孜孜，未尝稍懈。本人以弘扬孔教儒学为己任，自一九九二年接任院长以来，在国内外弘扬孔教儒学，足迹走遍祖国大江南北，世界五大洲四大洋，发表演讲及文章达七百多篇。弘扬孔教儒学，不但要有理论的提高，更要有教义的普及，让广大人民群众都认识 孔子 尊崇孔子，学习孔子的教诲，按孔教 儒家思想 做人处事，治国平天下。现任院长为汤恩佳博士。
学院宗旨
“仁、义、礼、智、信”为核心的基本教义，孔子整理并阐释的古代经典，连同《 论语 》，成为孔教的经典。儒教在当时已得到广泛传播，有弟子三千，组成庞大的宗教团体。 刘彻 时采纳 董仲舒 建议，实行“罢黜百家，独尊儒术”的政策，标志着儒教从此成为国教。到了东 刘庄 永平二年，中央政府下令所有郡、县、乡、学校，皆祀圣师 孔子 。从汉武帝时代到清朝中期，儒教一直保持着国教的地位， 儒家思想 一直是全民的主导思想。到了 唐代 ，全国各地普遍建 孔子庙 ，举行祭祀，儒教作为国教的地位得以强化。宋明理学家以天理观的方式表述了终极关怀的思想，使 儒家 的宗教天命观理论化、思辨化。宋明理学家在传播儒教方面也作了很大的贡献，他们将儒教同学校教育结合起来，儒教的四书五经成为中国教育及科举的主要内容。在弘扬儒教的神州大地，历代都出现大儒，如 孔子 、 曾子 、 颜回 、 孔伋 、 孟子 、 董仲舒 、 韩愈 、 周敦颐 、 张载 、 程颐 、 程颢 、 朱熹 、 陆九渊 、 王守仁 、 王夫之 等伟大的儒家。 中国 在历史上正因为有了儒教，才能以 孔子 儒家思想 为精神纽带，形成地域广大、人口众多的中华民族。从 西汉 至 第一次鸦片战争 时期，中国的人口基本上保持在全世界人口的三分之一以上，可以说，在这漫长的历史时期，全球三分之一以上的人，都是儒教信徒。
发展规划
1、争取国家将孔教作为宗教，以孔子的思想作为整个中华民族精神的轴心，增强中华民族的凝聚力。
2、计划筹建孔子纪念堂，将此作为宣传孔教儒学的基地，并辐射到全世界。
3、在孔教学院网站上建设孔教 网络大学 ，向社会各界传播孔教理论，培养孔教人才。
4、继续推动特区政府将孔子诞辰定为 孔子 教师节 和 圣诞节 ，成为公众假期。
5、将孔儒思想纳入小学、中学及大学的教材范围，大力发展以德育为本的教育，作为国家精神文明的支柱，与国家的经济、政治、科技等物质文明同步发展。孔教学院已编制好《香港小学儒家德育课程》、《香港中学儒家德育与公民教育课程》，现极力向各中小学推广，用以 孔子 儒家思想 培养人们的道德观。
6、研究适合于现代的孔教理论，制定适合于现代的孔教教规，重新诠释孔教经典，广泛传播孔教经典。
7、筹建中国 孔教总会 ，推动全国的孔教事业发展。
8、在各大小城市广设孔圣教堂或孔教青年会, 开设教义讲座及举办各类进修课程及提供各类康乐体育设施，将孔教道理融入日常生活中，让老、中、青各阶层有“以文会友，以友辅仁”的场所。
社会公益活动
协办《一代伟人周恩来》大型专题展览
2011年6月28日下午， 香港 孔教学院作为协办单位，参与由香港各界文化促进会、 新界 工商业总会、香港佛教文化产业、 香港广东社团总会 、香港友好协会、 香港中华总商会 、中国养老基金会、香港潮属社团总会、香港福建社团总会、香港中国商会等18个团体主办的《一代伟人周恩来》大型专题展览在 香港中央图书馆 揭幕。全国政协副主席董建华、中央驻港联络办副主任李刚、中共中央文献研究室副主任 李捷 、周恩来四位亲属等出席主礼。
展览通过大量历史图片、珍贵文物及纪录片，以“寻求救国真理 致力中华崛兴”“扩大爱国阵营 筹划开国大业”“指导 香港 工作”等九个主题立体展现周恩来伟大一生及贡献。
展览中周恩来“ 精研业务，提高效率，反对浪费，严守纪律 ”的手迹引得众多观众排队合影留念。“ 指导 香港特别行政区 工作 ”板块也吸引了很多参观者，其中展出了1956年周总理会见 香港大学 师生、香港工商界、影视界、文化界的照片原件以及对“东江水供港”计划安排的文件等珍贵文物。此外，还展出了1949年 新中国成立 特辑原件、周恩来指示制订国徽和国旗方案原件等珍贵历史文物。
展览展示了周恩来从青少年时期到逝世前的历史图片、文物、手迹等，反映其在中国人民和国际社会的巨大影响力。其中周恩来穿过的 睡衣 、用过的笔袋和垫子都是首次公开展出。
展览突出展现周恩来与 香港 的密切联系，包括在1927年辗转香港治病的照片，1956年会见 香港大学 师生的照片，1957年发表的《关于香港问题的讲话》，上世纪60年代初对“东江之水越山来”计划的安排等。
开幕礼云集 香港特别行政区 各界嘉宾逾700人，出席的周恩来亲属除 周秉德 外，还有周恩来侄女 周秉建 及侄子 周秉和 、 周秉钧 。全国政协副主席董建华，中联办副主任 李刚 ，外交部驻港特派员公署副特派员 詹永新 ， 中国人民解放军驻香港部队 周伟军 大校 ，周恩来总理贴身卫士、原中央警卫局副局长高振普将军，原国家主席李先念女儿 李紫阳 女士，周恩来邓颖超研究中心主任 廖心文 女士等也专程从北京来港参加活动。
中共中央文献研究室副主任 李捷 在致辞时表示，周恩来是中国共产党领导中国革命和建设辉煌历史的卓越领导者，他时时不忘祖国统一大业，为解决 香港特别行政区 、澳门和台湾问题做了大量基础性、开拓性工作，为促进香港繁荣、增进香港与祖国联系作出过历史性贡献。
周恩来侄女 周秉德 在开幕致辞中表示， “展览内容丰富，很有启发性和教育意义。我看有很多青年人参观展览非常欣慰，这能使他们加深对祖国近代史、老一代革命家的认识，意义深远。” 在香港回归祖国14年纪念日之前举办这个展览，对港澳同胞了解中国近代史、了解老一辈中国领导人与港澳的历史渊源非常有意义。她指出，周恩来在 新中国成立 后关心 香港特别行政区 问题，做了一系列的工作，为后来香港顺利回归祖国奠定了基础。
展览于6月26日至29日一连四天在港展出。据悉，首日的展出已吸引超过2500人入场观看。
出席开幕式的主要政界、商界知名人士还包括：全国政协常委 杨孙西 、全国政协常委 戴德丰 、全国人大代表 霍震寰 、香港各界文化促进会会长 杨剑 、 香港中华总商会 会长蔡冠深、香港佛教文化产业主席祖古白玛奥色仁波切、香港广东客属社团联合总会主席梁亮胜、 香港广东社团总会 主席 王国强 、香港福建社团总会主席 林树哲 、香港潮属社团总会主席 许学之 、 亚洲电视 执行董事高级顾问王征、 香港友好协进会 主席 陈永棋 、香港学生发展及活动基金会主席龙子明、 新界 工商业总会会长江达可、百仁基金主席 施荣忻 等。
协办 世界和平祈祷大会
香港孔教学院于2012年4月20日至5月4日作为协办单位，参与由 联合国友好理事会 、 中国国际友好联络会 、联合国世界人民理事会、联合国发展基金会、联合国艺术家理事会、世贸企业促进会、中国养老基金会、美国罗省中华总商会、 香港工会联合会 、九龙社团联会社会服务基金、 新界社团联会 社会服务基金、香港青年联会、香港潮属社团总会、 香港广东社团总会 、香港广西社团总会主办，香港佛教文化产业承办，海内外三百多个社团组织共同参与的 「推动 联合国 千年发展计划· 世界和平祈祷大会 暨庆祝香港特区成立十五周年」 大会，在全港举行一系列大型公益活动，是庆祝 香港回归 十五周年的重要庆典，也是香港首次举办推动联合国千年计划大型活动，旨在推动世界和平。
大会执行主席由 联合国友好理事会 全球事务秘书长祖古白玛奥色仁波切担任；大会共同主席分别是： 香港工会联合会 会长、全国人大代表郑耀棠 金紫荆星章 太平绅士，中国养老基金会会长 李紫阳 、全国青联副主席 陈仲尼 BBS 太平绅士。
学院院长汤恩佳博士担任本次 世界和平祈祷大会 顾问。
此次大会展现三个主题，分别是「和平、博爱、希望」，展现人类追求和平、博爱和充满希望，活动获香港政府、中央政府、中联办领导及多个部门、机构全力支持。在 香港 政府大力支持下，於 维多利亚公园 四个球场，举行慈善大型 嘉年华 活动，15馀万人参与。大会主题为<博爱、和平、希望>，举办了世界和平颁奖大典，免费派发12万斤「世界和平吉祥米」予老人、妇女及弱势群体。举行多场大型「千人盆菜宴」，宴请2000多位老人。
此次大会是首次在 香港特别行政区 举行的最大型宣传世界和平的活动，『和平大会』将依照 联合国 的「千年宣言」，宣传和发表「千年发展目标」，致力推广和维护联合国宣导21世纪 国际关系 的基本价值：自由、平等、团结、包容、尊重大自然、共同承担责任。「和平大会」至今已收到由中国政府高级官员、 美国国会 、 加利福尼亚州 州政府财务长及各市市长、社会名人等发出的贺函。2000年9月联合国首脑会议上由189个国家签署《联合国千年宣言》，正式做出此项承诺，中国亦积极回应联合国的倡议，为实现千年发展目标做了不懈努力。
联合国友好理事会 全球事务秘书长（大会执行主席）祖古白玛奥色仁波切、 香港工会联合会 会长全国人大代表（大会共同主席）郑耀棠太平绅士、联合国友好理事会主席努尔．布朗博士、联合国世界人民理事会主席Kazan Retrey Sherrill、立法会主席曾钰成、中联办副主任王志民、中联办社会工作部部长张铁夫、全国政协委员 卢温胜 张人龙 、全国政协委员王惠贞太平绅士、两岸和平发展联合会会长 陈守仁 、原国家主席李先念之女，中国养老基金会会长 李紫阳 、 商务及经济发展局 常任秘书长谢曼怡太平绅士、 香港特别行政区立法会 议员 陈鉴林 太平绅士、香港立法会议员 谭伟豪 太平绅士、 九龙城区 议会主席刘伟荣太平绅士、中国民营企业国际合作发展促进会会长 张维新 等各界知名人士出席大会开幕式。