从头合成

生物体内合成生物分子的途径

从头合成(denovo synthesis):生物体内用简单的 前体 物质合成 生物分子 的途径。

合成途径

体内 核苷酸 的合成有两条途径:①利用磷酸 核糖 、氨基酸、一碳单位及 等简单物质为原料合成核 酸的过程,称为从头合成途径(denovo synthesis),是体内的主要合成途径。②利用体内游离 碱基 或 核苷 ,经简单反应过程生成核苷酸的过程,称重新利用(或补救合成)途径(salvage pathway)。在部分组织如脑、骨髓中只能通过此途径合成核苷酸。 嘌呤核苷酸 的主要补救合成途径是 嘌呤碱 与 在磷酸核糖转移酶作用下形成嘌呤核苷酸。

合成过程

嘌呤 核苷酸的从头合成

早在1948年,Buchanan等采用 同位素 标记不同化合物喂养鸽子,并测定排出的尿酸中标记原子的位置的同位素示踪技术,证实合成 嘌呤 的前身物为:氨基酸( 甘氨酸 、 天门冬氨酸 ( 天冬氨酸 )、和谷氨 胺)、 和一碳单位 。

随后,由Buchanan和Greenberg等进一步搞清了 嘌呤核苷酸 的合成过程。出人意料的是,体内嘌呤核苷酸的合成并非先合成 嘌呤碱基 ,然后再与 核糖 及磷酸结合,而是在磷酸核糖的基础上逐步合成嘌呤核苷酸。嘌呤 核苷酸 的从头合成主要在胞液中进行,可分为两个阶段:首先合成 次黄嘌呤 核苷酸(inosine monophosphate IMP );然后通过不同途径分别生成 。下面分步介绍 嘌呤核苷酸 的合成过程。

IMP的合成

1.IMP的合成:IMP的合成包括11步反应:

(1)5-磷酸 核糖 的活化: 嘌呤核苷酸 合成的起始物为 ,是 戊糖磷酸途径 代谢产物。嘌呤核苷酸生物合成的第一步是由 磷酸戊糖焦磷酸激酶 ( 核糖 磷酸盐 pyrophosphohinase) 催化 ,与 atp 反应生成 。此反应中ATP的 焦磷酸 根直接转移到5-磷酸核糖C1位上。 PRPP 同时也是 核苷酸及 组氨酸 、 色氨酸 合成的 前体 。因此,磷酸戊糖焦磷酸激酶是多种生物合成过程的重要酶,此酶为一变构酶,受多种代谢产物的变构调节。如PPi和2, 为其变构 激活剂 。 ADP 和GDP为变构 抑制剂 。

(2)获得 嘌呤 的N9原子:由磷酸 核糖 酰胺 转移酶(amidophosphoribosyl transterase) 催化 ,谷氨酰胺提供酰胺基取代 PRPP 的 焦磷酸 基团,形成 。此步反应由焦磷酸的 水解 供能,是嘌呤合成的限速步骤。 酰胺 转移酶为限速酶,受 嘌呤核苷酸 的反馈抑制。

(3)获得嘌呤 原子:由 甘氨酰胺核苷酸 合成酶(glycinamide ribotide synthetase)催化 甘氨酸 与PRA缩合,生成甘氨酰胺核苷酸(glycinamide ribotide,GAR)。由 atp 水解供能。此步反应为可逆反应,是合成过程中唯一可同时获得多个原子的反应。

(4)获得 嘌呤 原子:GAR的自由α- 氨基甲酰 化生成甲酰甘氨酰胺核苷酸(formylgly?cinamide ribotide FGAR)。由 。 催化 此反应的酶为GAR甲酰转移酶(GAR transtormylase)。

(5)获得嘌呤的 原子:第二个谷氨 酰胺 的酰胺基转移到正在生成的嘌呤环上,生成 甲酰甘氨 核苷酸 (formylglycinamidine ribotide,FGAM)。此反应为耗能反应,由 atp 水解 生成 供能。

(6) 嘌呤 咪唑 环的形成:FGAM经过耗能的分子内重排, 环化 生成

(7)获得嘌呤 ,由AIR羧化酶(AIR carboxylase) 催化 生成 羧基 氨基 咪唑 核苷酸 (carboxyamino imidazole ribotide,CAIR)。

(8)获得N1原子:由 天门冬氨酸 与AIR缩合反应, 。此反应与(3)步相似,由 atp 水解 供能。

(9)去除 反丁烯二酸 :SACAIR在SACAIR 甲酰 转移酶 催化 下脱去延胡索酸生 。(8)、(9)两步反应与 尿素 循环中 精氨酸 生成 鸟氨酸 的反应相似。

(10)获得 : 嘌呤 环的最后一个C原子由 提供,由AICAR甲酰转移酶催化AICAR甲酰化生成 ,FAICAR)。

(11) 环化 生成 IMP :FAICAR脱水环化生成 IMP。与反应(6)相反,此环化反应无需 atp 供能。

由IMP生成AMP和GMP

2.由IMP生成AMP和GMP

上述反应生成的IMP并不堆积在细胞内,而是迅速转变为AMP和GMP。 AMP 与 IMP 的差别仅是6位 酮基 被 氨基 取代。此反应由两步反应完成。(1) 天门冬氨酸 的氨基与IMP相连生成 腺苷酸代琥珀酸 (adenylosuccinate),由腺苷酸代琥珀酸合成酶催化, GTP 水解 供能。(2)在腺苷酸代琥珀酸裂解酶作用下脱去 反丁烯二酸 生成AMP。

GMP的生成也由二步反应完成。(1)IMP由IMP脱氢酶 催化 ,以NAD+为受氢体,氧化生成 黄嘌呤 核苷酸 (xanthosine monophosphate,XMP)。(2)谷氨 酰胺 提供酰胺基取代XMP中C2上的氧生成GMP,此反应由GMP合成酶催化,由 atp 水解供能。

一磷酸核苷磷酸化

3.一磷酸核苷磷酸化生成 二磷酸核苷 和三磷核苷。

要参与 核酸 的合成。一磷酸核苷必须先转变为二磷酸核苷再进一步转变为 核苷三磷酸 。二磷酸核苷由 碱基 特异的核苷一磷酸激酶(nucleoside monophosphate kinase) 催化 ,由相应一磷酸核苷生成。例如腺苷激酶催化 AMP 磷酸化生成 ADP

二磷酸核苷激酶对底物的碱基及 戊糖 ( 核糖 或 脱氧核糖 )均无特异性。此酶催化反应系通过“乒乓反应”,即底物 NTP 使酶分子的组氨酶残基磷酸化,进而催化底物NDP的磷酸化。反应 ,为可逆反应。

从头合成的调节

4. 嘌呤核苷酸 从头合成的调节

从头合成是体内合成嘌呤核苷酸的主要途径。但此过程要消耗氨基酸及 atp 。机体对合成速度有着精细的调节。在大多数 细胞 中,分别调节 IMP ,ATP和 GTP 的合成,不仅调节嘌呤核苷酸的总量,而且使ATP和GTP的水平保持相对平衡。

IMP途径的调节主要在合成的前二步反应,即 催化 PRPP 和PRA的生成。 核糖磷酸焦磷酸激酶 受 ADP 和GDP的反馈抑制。磷酸 核糖 酰胺 转移酶受到ATP、ADP、 AMP 及GTP、GDP、GMP的反馈抑制。 ATP 、ADP和AMP结合酶的一个抑制位点,而GTP、GDP和GMP结合另一抑制位点。因此,IMP的生成 速率 受腺嘌呤和 鸟嘌呤核苷酸 的独立和协同调节。此外,PRPP可变构激活磷酸 核糖 酰胺 转移酶。

第二水平的调节作用于IMP向AMP和GMP转变过程。GMP反馈抑制IMP向XMP转变,AMP则反馈抑制IMP转变为 腺苷酸代琥珀酸 ,从而防正生成过多AMP和GMP。此外,腺嘌呤和鸟嘌呤的合成是平衡。 GTP 加速 IMP 向 AMP 转变,而 atp 则可促进 GMP 的生成,这样使腺嘌呤和鸟嘌呤核苷酸的水平保持相对平衡,以满足 核酸 合成的需要。