细胞质(cytoplasm)，又称胞质、胞浆，细胞质的主要成分是胞质溶胶（一种凝胶状物质）、 细胞器 （细胞的内部亚结构）和各种细胞质内含物。细胞质属于一种原生质，与原生质同样是由水、盐、有机分子及各种 催化 反应的酶所组成。其中，细胞质含水量约80%，主要成分为核糖体、贮藏物、多种酶类和中间代谢物、各种营养物和大分子的单体等，还含有质粒，少数细菌还有类囊体、羧酶体、气泡或伴孢晶体等，通常是无色的。细胞质的胞质溶胶具“分子液”功能，且能使细胞质内各种细胞器和胞质包涵体呈悬浮状态，而细胞质本身是透过脂质膜聚集在一起的。
细胞质是整个细胞运作的主要场所，透过细胞膜外接收的讯息、细胞内部的物质，共同调节基因的表现，影响生理活动。细胞质可粗略分为细胞质基质和胞器。细胞质含有维持生命现象所需要的基本物质，例如 糖类 、脂质、 蛋白质 、与蛋白质合成有关的 核糖核酸 。细胞质内部有多种网状构造，称为 细胞骨架 ，可以协助维持细胞形状，也能引导内部物质的移动，一些细胞骨架会于细胞分裂时，形成可以透过染色而观察的纺锤丝，有一些骨架更能帮助 细胞运动 。
细胞质骨架体系主要包括 微丝 、 微管 以及中间纤维。它们分布在整个 细胞 中，就像混凝土中的钢筋一样，可以增强细胞抗机械压力的能力。微丝，又称肌动蛋白纤维，与细胞中许多重要的功能活动有关，如 肌肉收缩 ，变形运动，胞质分裂等；微管，是由微管蛋白二聚体装配成的长管状 细胞器 结构，主要功能是维持细胞形态，协助 胞内运输 ，在细胞分裂期装配形成纺锤体等。
简介
细胞质基质又称胞质溶胶，是细胞质中均质而半透明的 胶体 部分，充填于其他有形结构之间，是细胞质的基本成分，主要含有多种可溶性酶、糖、 无机盐 和水等。细胞质基质的主要功能是：为各种细胞器维持其正常结构提供所需要的离子环境，为各类细胞器完成其功能活动供给所需的一切物质。细胞质是进行 新陈代谢 的主要场所，绝大多数的化学反应都在细胞质中进行。同时它对 细胞核 也有调控作用。
组成
细胞质(cytoplasm)又称胞浆是由细胞质基质、 内膜系统 、 细胞骨架 和包涵物组成。
细胞质包括基质、 细胞器 和 包含物 ，在生活状态下为透明的胶状物。
基质指细胞质内呈液态的部分，是细胞质的基本成分，主要含有多种可溶性酶、糖、 无机盐 和水等。
细胞 器是分布于细胞质内、具有一定形态、在细胞生理活动中起重要作用的结构。它包括： 线粒体 、 叶绿体 、 内质网 、内网器、 高尔基体 、溶酶体、 微丝 、 微管 、 中心粒 、 核糖体 等。
细胞质基质
细胞质基质又称胞质溶胶（cytosol)是细胞质中均质而半透明的 胶体 部分，充填于其它有形结构之间。细胞质基质的 化学 组成可按其分子量大小分为三类，即 小分子 、中等分子和大分子。小分子包括水、 无机 离子；属于中等分子的有 脂类 、 糖类 、氨基酸、 核苷酸 及其 衍生物 等；大分子则包括 多糖 、 蛋白质 、 脂蛋白 和 核糖核酸 等。细胞质基质的主要功能是：为各种 细胞器 维持其正常结构提供所需要的离子环境，为各类细胞器完成其功能活动供给所需的一切 底物 ，同时也是进行某些生化活动的场所。
内膜系统
内膜系统(endomembrane system）是通过细胞膜的内陷而演变成的复杂系统。它构成各种细胞器（organelle)，如 内质网 、 高尔基体 、溶酶体等。这些细胞器均是互相分隔的封闭性区室，各具备一套独特的酶系，执行着专一的生理功能。
内质网
（endoplasmic reticulum，ER）是扁平囊状或管泡状膜性结构，它们以分支互相吻合成为网络，其表面有附着核糖核蛋白s体者称为粗面内质网（rough endoplasmic reticulum，RER），膜表面不附着 核糖体 者称为滑面内质网（smooth endoplasmic reticulum，SER），两者有通连。
核糖核蛋白体附着在 内质网 上，其主要功能是合成分泌 蛋白质 ( 如 免疫球蛋白 、消化酶等），但也制造某些结构蛋白质(如膜镶嵌蛋白质、溶酶体酶等）。粗面内质网分布于绝大部分 细胞 中，而在分泌蛋白旺盛的细胞（如浆细胞、腺细胞），粗面内质网特别发达，其扁囊密集呈板层状，并占据细胞质很大一部分空间。一般说来，可根据粗面内质网的发达程度来判断细胞的功能状态和分化程度。
滑面内质网多是管泡状，仅在某些细胞中很丰富。并因含有不同的酸类而功能各异，① 类固醇 激素的合成，在分泌类固醇激素的细胞中；滑面 内质网 膜上有合成胆固醇所需的酶系，在此合成的胆固醇再转变为类固醇激素；② 脂类 代谢， 小肠 吸收 细胞 摄入 脂肪酸 、 丙三醇 及 甘油一酯 ，在滑面内质网上酯化为甘油三酯，肝细胞摄取的脂肪酸也是在滑面内质网上被氧化还原酶分解，或者再度酯化；③解毒作用，肝细胞的滑面内质网含有参与解毒作用的各种酶系，某些外来药物、有毒代谢产物及激素等在此经过氧化、还原， 水解 或结合等处理，成为无毒物质排出体外；④离子贮存与调节，横纹肌细胞中的滑面 内质网 又称肌浆网，其膜上有钙泵，可将细胞质基质中的 ca(clo)2 +泵入、贮存起来，导致肌细胞松弛，在特定因素作用下，贮存的Ca2+释出，引起肌细胞收缩。胃底腺壁细胞的滑面内质网有氯泵，当分泌 盐酸 时将CIˉ释放，参与盐酸的形成。
高尔基复合体
（Golgi complex）由扁平囊、小泡和大泡三部分组成，它在 细胞 中仿分布和数量依细胞的类型不同而异。扁平囊(saccule) 有3-10 层，平行紧密排列构成高尔基复合体的主体，它有一面常凸超称生成面(forming face),另一面凹陷，称成熟面（maturing face)。扁平囊上有孔穿通，并朝向生成面。生成面附近有一些小泡(vesicle)，直径为40～80nm,是由附近粗面 内质网 芽生而来，将粗面内质网中合成的 蛋白质 轻运到扁平囊。，故小泡又称运输小泡。大泡(vacuole）位于成熟面，是 高尔基体 的生成产物，包括溶酶体、分泌泡等。溶酶体逐渐离开高尔基复合体而分散到 细胞 各部。分泌泡互相融合，其内容物电子密度增高，成为分泌颗粒。在蛋白质分泌旺盛的细胞中高尔基复合体发达。高尔基复合体对来自粗面内质网的蛋白质进行加工、修饰、糖化与浓缩，使之变为成熟的蛋白质，如在胰岛B细胞 中将 前 胰岛素 加工成为胰岛素。高尔基复合体具有多种糖基转移酶，许多 蛋白质 在此被糖化形成糖蛋白。此外，多种溶酶体也在高尔基复合体浓聚形成初级溶酶体。
溶酶体
（lysosome)为有膜包裹的小体，内含多种酸性水解酶，如酸性磷酸酶、组织蛋白酶、 胶原蛋白 酶、核糖核酸酶、葡萄糖苷酸和脂酶等，能分解各种内源性或 外源性 物质。它们的最适ph为5.0。不向 细胞 中的溶酶体不尽相同，（但均含酸性磷酸酶，故该酶为溶酶体的标志酶。按溶酶体是否含有被消化物质（底物）可将其分为初级溶酶体(primary lysosme)和次级溶酶体(secondary lysosome)。
(1)初级溶酶体：也称原溶酶体(protolysosome)。一般呈圆形或椭圆形，直径多介于25～50nm，现如今发现亦有长杆状或管状溶酶体。其内容物呈均质状，电子密度中等或较高不含底物。在少数 细胞 ，如破骨细胞和炎症部位的中性粒细胞，溶酶体酶可被释放到细胞外发挥水解作用
(2)次级溶酶体：也称吞噬性溶酶体(phagolysosome),是由次级溶酶体和将被 水解 的各种吞噬底物融合而构成，因此其体积较大，形态多样，内容物为非均质状。根据其作用废物的来源不同，分为自噬性溶酶体和异噬性溶酶体。自噬性溶酶体（autophago lysosome)的作用底物是内源性的，即来自细胞内的衰老和崩解的 细胞器 或局部细胞质等。异噬性溶酶体（heterophago lysosome）的作用底物是经由 细胞 的吞饮或吞噬而被摄入细胞内的 外源性 物质，是溶酶体与吞噬体融合而成，多见于吞噬了细菌的中性粒细胞和吞噬了异物的巨噬细胞。并噬性溶酶体与自噬性溶酶体中的底物有的被分解为单糖、氨基酸等小分子物质，它们可通过溶酶体膜进入细胞质基质，被细胞利用；有的则不能被消化（如尘埃、金属颗粒等异物、衰老细胞器的某些 类脂 成分），它们残留于溶酶体中，当溶酶体酶活性耗竭，溶酶体内完全由残留物占据，则称之为残余体（residual body）。在哺乳动物，残余体滞留在 细胞 中，常见的残余体有脂褐素颗粒和髓样结构。均由自噬性溶酶体演化而来。脂褐素颗粒（lipofuscin granule)为不规则形，由电子密度不同的物质及脂滴构成，在光镜下呈褐色，多见于神经细胞、心肌细胞、肝细胞及分泌类固醇激素的细胞，并随年龄增长而增多。髓样结构(myelin figure）的内部为大量板层排列的膜，可能因膜性成分消化不全所致。初级溶酶体与吞饮小泡或其它小泡融合形成多泡体（multivesicular body），其外有界膜，内含很多低电子密度小泡，基质具有酸性鳞酸酶活性。
线粒体
（mitochondria) 常为杆或椭圆形，横径为 0.5～1ηm 长2～6ηm但在不同类型激胞中线粒体的形状、大小和数量差异甚大。电镜下，线粒体具有双层膜，外膜光滑，厚6～7nm，膜中有2～3nm小孔，分子量为1万以内的物质可自由通过；内膜厚5～6nm，通透性较小。外膜与内膜之间有约8nm。膜间腔，或称外腔。由膜向内折叠形成线粒体嵴（mitochohdrial crista），嵴之间为嵴间腔，或称内腔，充满线粒体基质。基质中常可见散在的、直径25～50nm的电子致密的嗜饿酸基质颗粒（matrix granule），主要由磷脂蛋白组成，并含有钙、镁、磷等元素。基质中除基质颗粒外还含有 脂类 、 蛋白质 、环状 脱氧核糖核酸 分子 核糖体 。线粒体嵴膜上有许多有柄小球体，即基粒（elementary particle)，其直径为8～10nm，它由头、柄和基片三部分组成。球形的头与柄相连而突出于内膜表面，基片镶嵌于膜脂中。
基粒中含有ATP合成酶，能利用呼吸链产生的能量合成ATP，并把能量贮存于ATP中。 细胞 生命活动所需能量的约95%由 线粒体 以ATP的方式提供，因此，线粒体是细胞能量代谢中心，线粒体嵴实为扩大了内膜面积，故代谢率高，耗能多的细胞。嵴多而密集大部分细胞的线粒体嵴为板层状。杆状线粒体的嵴多与其长轴垂直排列，圆形线粒体的嵴多以周围向中央放射状排列；在少数细胞，主要是分泌 类固醇 激素的细胞（如 肾上腺 皮质细胞等），线粒体嵴多呈管状或泡状；有些细胞（如肝细胞）的线粒体兼有板层状和管状两种。
线粒体另一个功能特点是可以合成一些 蛋白质 。现如今，科学家推测，在 线粒体 中合成的蛋白质约占线粒体全部蛋白的10%，这些蛋白疏水性强，和内膜结合在一起。线粒体合成蛋白质均是按照细胞核基因组的编码指导合成。如果没有细胞核遗传系统，线粒体RNA则不能表达。因此表明线粒体合成蛋白质的半自主性。
关于线粒体形成的机制，较普遍接受的看法是，线粒体依靠分裂而进行增殖。线粒体的发生过程可分为两个阶段，在第一阶段中，线粒体的膜进行生长和复制，然后分裂增殖。第二阶段包括线粒体本身的分化过程，建成能够行使 氧化磷酸化 功能的机构。 线粒体 生长和分化阶段分别接受两个独立遗传系统的控制，因此，它不是一个完全自我复制的实体。
过氧化氢酶体
过氧化物酶体 （peroxisome）又称微体（microbody），是有膜包裹的圆形小体，直径为0.2～0.4μm,多见于肝 细胞 与肾小管上疫细胞。在人其内容物为低 电子 密度的均质状；在某些动物尚含电子致密的核心，是尿酸 氢化酶 的结晶。 过氧化 物体含有40多种酶，不同细胞所含酶的种类不同，但 过氧化氢酶 则存在所有细胞的过氧化物酶体中。各种氧酶能使相应的 底物 氧化，在氧化底物过程中，氧化酶使氧还原成 过氧化氢 ，而 过氧化氢 酶能使过氧化氢还原成水。这种氧化反应在肝、肾细胞中是非常重要的。
核糖体
（ribosme) 是由 核糖体 RNA （rRNA）和 蛋白质 组成的椭圆形致密颗粒，并非膜性结构，（因属 细胞器 ，故在此叙述）颗粒大小约为15nm×25nm。核糖体由一个大亚基与一个 小亚基 构成。大亚基含两条rRNA与约40个相关蛋白质分子，并有一条中央曾；小亚基含一条rRNA与约40个相关蛋白质分子，非功能状态的核糖体 单个存在。当一定数量（3~30）的核糖体由一条mRNA细丝穿行于它们的大、小亚基之间把它们串联起来，则成为功能状态的多核糖体（polyribosome),电镜下呈串珠状或花簇状。 核糖体 能将m RNA 所含的 核苷酸 密码翻译为氨基酸序列，即肽链合成的肽链从大亚基中央管释出，肽链可进一步聚合形成 蛋白质 细胞质基 质中的游离核糖体（free ribosome)合成细胞自身的结构蛋白，如 细胞骨架 蛋白细胞基质中的酶类等，供细胞代谢、增殖和生长需要。因此，在旺盛增殖中的 细胞 游离核糖体极多。于 内质网 膜表面的附着核糖体（attached ribosome）除合成结构蛋白外，主要合成分泌性蛋白。核糖体丰富的细胞，光镜下胞质呈嗜碱性。
细胞骨架
细胞的特定形状以及运动等，均有赖于细胞质内蛋白质丝织成的 网状结构 ——细胞骨架（cytoskeleton）。细胞骨架是由 微管 、 微丝 、中间丝和微梁网组成。
微管
（microtubule）是细而长的中空圆柱状结构。管径约15nm,长短不等，常数根平行排列。微管由微管蛋白（tubulin）聚合而成。微管蛋白 单体 为直径约5nm的球形 蛋白质 ，它们串连成原纤维，13条原纤维纵向平行排列围成微管。微管有单微管、二联微管和三联做管三种类型。 细胞 中绝大部分微管为单微管，在低温、Ca2+和 秋水仙碱 作均下易解聚为微管蛋白，故属于不稳定微管。二联 微管 主要位于纤毛与精子鞭毛中，三联微管参与构成中心体和基体，均为稳定微管。
微管具有多种功能。微管的支架作用可保持细胞形状，如血小板周边部的环行微管使其呈双凸圆盘状，神经细胞的微管支撑其突起，如果加入秋水仙素使微管解聚，则血小板变圆，神经细胞突起缩回。微管参与细胞的运动，如细胞分裂时，由微管组成的纺锤体可使 染色体 向两极移动，如果加入秋水仙素则分裂停止于中期，纤毛和鞭毛的摆动、胞吞和胞吐作用、细胞内物质的运送都需要微管参与。
微丝
（microfilament）广泛存在于多种 细胞 中，微丝常成群或成束存在，在一些高度特化的细胞（如 肌细胞 ），它们能形成稳定的结构，但更常见的是形成不稳定的束或复杂的网。它们可根据 细胞周期 和运动状态的需要，改变其在细胞内的形态和 空间位置 ，并能够根据在细胞的不同状态而聚合或解聚。
分布于肌细胞和非肌细胞中的微丝分细丝和粗丝两种。细丝（thin filament）直径约6nm，长约lμm，主要由 肌动蛋白 （actin）组成，故又称 微丝 （actinfilament），通常所说的 微丝 指此而言。 细胞 松弛素 B能使细丝解聚，从而 抑制细胞 运动；粗丝（thick filament）直径侧10～15nm，长约1.5μm，主要由肌球蛋白（myosin）组成，故又称肌球蛋白丝（myosinfilament）。微丝是 肌细胞 内的恒定结构。在 横纹肌 细胞内；细丝与粗丝以一定比例（约为2:1）有规则排列成肌原纤维，其收缩机制已明确。平滑肌细胞内细丝与粗丝之比约为15:1，二者的排列不规则。非肌细胞中一般只能看到细丝，粗丝可能因存在时间短暂，或于电镜标本制备过程中解聚为肌球蛋白，难于观察到。在某些因素作用下，非肌细胞中的 微丝 迅速解策为其结构蛋白；在相反因素作用下，结构蛋白又装配成微丝。其中细丝交联成网以构成 细胞骨架 的一部分，并维持细胞质基质的胶质状态；细丝与粗丝的局部相互作用能引发运动。在活跃运动的 细胞 （主要在细胞质周边部）或细胞局部（如 伪足 ），以及需察机械支持的部位（如 微绒毛 )，都有丰富的微丝。因此，微丝除具有支持作用外，还参与细胞的收缩、变形运动、细胞质流动、细胞质分裂以及胞吞、胞吐过程。
中间丝
(intermediate fila ment)又称中等纤维，直径约为8～11nm，介于细丝与粗丝之间，因而得名。中间丝可分为五种，各由不同 蛋白质 构成。在成体中绝大部分细胞仅含有一种中间丝，故具有组织特异性，且较稳定。五种中间丝的形态相仿，难于分辨。但用 免疫组织化学 方法则能将它们区分，从而可进一步分析 细胞 的类型。
(1) 角质 蛋白丝（keratin filament）：分布于上皮细胞，在 复层扁平上皮 细胞内尤其丰富，常聚集成束，又称 张力 丝（tonofilament)。张力丝附着于桥粒（一种 细胞连接 ），能加固细胞间的连接。张力丝除起支持作用外，还有助于保持细胞的韧性和弹性。
(2) 结蛋白丝（desmin filament)：分布于 肌细胞 ，在 横纹肌 细胞内，结蛋白丝所形成的细网连接相邻肌原纤维并使肌节位置对齐；在Z膜股处，细网包围肌原纤维并与细胞膜连接。在平滑肌细胞内，结蛋白丝连接在密体与密斑之间形成立体网架，并与 微丝 相连。总之，结蛋白丝作为肌细胞的 细胞骨架 网，发挥固定和机械性 整合作用 。
(3) 波形蛋白丝(vimentin fila ment）：主要存在于成 纤维细胞 和来自 胚胎 间充质的细胞。在少数含有两种中间丝的 细胞 中， 波形蛋白 丝是其中的一种，波形蛋白丝主要在核周形成网架，对核起机械性支持，并稳定其在细胞内的位置。
(4) 神经丝（neurofilament):存在于神经细胞的胞体与突起中，由神经丝蛋白组成，与 微管 共同构成细胞骨架，并协助物质运输。
(5) 神经胶质丝（neurogial filament)：主要存在于星形胶质细胞内，由胶质原纤维酸性蛋白组成，多聚集成束，交织走行于胞体，并伸入突起内。
微梁网
（microtrabecular lattict）是用超高压电镜等技术在完整 细胞 中观察到的由直径3～6nm的纤维交织形成的立体网架。有人认为它是一种镶嵌在其 它纤维系统中的微梁网格。也有人认为，它是 微管 、 微丝 和中间丝系统紧密联系和 交错 相插，或是某些被磨
损的 细胞骨架 所显示的图像。总之，它仍是一个有争议的结构。
中心体
中心体（centrosome)多位于 细胞核 周围，由一对互相垂直的 中心粒 （centriole)构成。中心粒呈是短圆筒状，长0.5μm直径为外0.2μm，由9组三联微管与少量 电子 致密的均质状物构成其壁。相邻的三联微管相互斜向排列，状如风车旋翼。在壁外侧有时可见9个球形的中心粒 卫星 (centriolar satellite）。大小约70nm。在 细胞分裂 时，以中心粒 卫星 为起点形成 纺锤体 ，参与 染色体 的分离（详见" 细胞周期 " )。有纤毛或鞭毛的 细胞 ，中心粒形成 基体 ，参与 微管 组的形成。
包涵物
是细胞质中本身没有代谢活性，却有特定形态的结构。有的是贮存的能源物质，如糖源颗粒、脂滴；有的是 细胞产物 ，如分泌颗粒、 黑素 颗粒；残余体也可视为包涵物。
糖原颗粒
（ glycogen granule）是 细胞 贮存 葡萄糖 的存在形式，于PAS反应时呈红色。电镜下，其 电子 密度高，无膜包裹，并呈两种类型：β颗粒，直径为20～30nm，形状不规则，分散存在。多见于 肌细胞 ；α颗粒，是β颗粒的聚合体，呈花簇状，大小不一，多见于 肝细胞 。
脂滴
（fat drop）是 细胞 贮存 脂类 的存在形式，内含 甘油三酯 、 脂肪酸 、胆固醇等。脂滴在 脂肪细胞 中最多， 其次为分泌 类固醇 激素的细胞。在前者，常常一个脂滴即占据细胞的绝大部分空间；在后者，则多是小的球状。在普通光镜标本制备过程中，脂滴被 二甲苯 、 乙醇 溶解而遗留大小不等的空泡。电镜下，脂滴无膜包裹，多是低或中等 电子 密度，与所含脂肪酸的不饱和程度有关。
分泌颗粒
（secretory granule）常见于各种腺细胞、内含酶、激素等 生物活性 物质。分泌颗粒的形态、大小及在 细胞 内的分布位置因细胞种类而异，但都有膜包裹。
细胞质遗传
细胞质遗传的物质基础是细胞质中的 脱氧核糖核酸 ，细胞质遗传在实践中的应用很广泛。
概念
由细胞质基因所决定的遗传现象和遗传规律，也称为非 格雷戈尔·孟德尔 遗传，核外遗传。
特性
1． 后代的表型象母亲( 又叫母系遗传，偏母遗传) ；
2． 不遵循孟德尔遗传，后代不出现一定的比例；
3． 正交 和反交后代的表型不同。
机制
精卵结合中形成的合子父母双亲所提供的 遗传物质 不均等，在杂种 受精 卵 的 原生质 体中，核来自于父母双方，而细胞质却几乎完全来自其母亲(精子受精时胞质很少甚至不能进入 卵细胞 中)。
在 细胞 分裂过程中，细胞质基因呈现不均等分配，因此细胞质遗传不遵循孟德尔定律。
物质基础
线粒体基因组 (mtDNA)
细胞 共生体基因组
细菌 质粒 基因组
非 细胞器 基因组
细胞器基因组
细胞质基因组
叶绿体基因组
1. 细胞核 遗传与细胞质遗传的区别
(1)细胞核和细胞质的 遗传物质 都是 脱氧核糖核酸 分子，但是分布的位置不同。细胞核遗传的遗传物质在细胞核中，细胞质遗传的遗传物质在细胞质中。
(2)细胞核和细胞质的遗传桥梁都是 配子 ，但是细胞核遗传雌雄配子的核遗传物质 相等 ，而细胞质遗传物质主要存在于 卵细胞 中。
(3)细胞核和细胞质的 性状 表达主要通过体细胞进行的。核遗传物质的载体( 染色体 )有均分机制，进行均分遵循遗传规律；细胞质遗传物质的载体(具有 DNA 的 细胞器 )没有均分机制，而是随机的。
(4) 细胞核 遗传时，正反交相同。细胞质遗传时，F1的性状均与母本相同，即母系遗传。
2. 线粒体 和 叶绿体 是半自主性细胞器
研究发现， 线粒体 和 叶绿体 中除有 脱氧核糖核酸 外，还有 核糖核酸 (mRNA、 转运RNA 、rRNA)， 核糖体 等。说明这两种细胞器都具有独立进行 转录 和翻译的功能，也就是说， 线粒体 和叶绿体都具有自身转录RNA和翻译 蛋白质 的体系。但迄今为止，人们发现叶绿体只能合成13种蛋白质，线粒体能够合成的蛋白质也只有60多种，而参与组成线粒体和叶绿体的蛋白质却分别上千种。这说明，线粒体和叶绿体中自身编码，合成的蛋白质并不多，它们中的绝大多数蛋白质是由核基因编码，在细胞质核糖体上合成的。也就是说， 线粒体 和 叶绿体 的自主程度是有限的，它们对核遗传系统有很大的依赖性。因此， 线粒体 和叶绿体的生长和增殖是受核 基因组 及自身的基因组两套遗传信息系统控制的，所以它们都被称为半自主性 细胞器 。
作用
细胞 质是进行 新陈代谢 的主要场所，绝大多数的化学反应都在细胞质中进行。同时它对 细胞核 也有调控作用。
细胞质（cytoplasm）细胞质膜以内、细胞核以外的部分。由均质半透明的胞质溶胶（cytosol）和细胞器及内含物组成。胞质溶胶约占 细胞 体积1/2，含 无机 离子（如K+、Mg2+、 Ca2 +等）、 脂类 、 糖类 、氨基酸、 蛋白质 （包含酶类及构成 细胞骨架 的蛋白）等。骨架蛋白与细胞形态和运动密切相关，被认为对胞质溶胶中酶反应提供了有利的框架结构。绝大部分物质中间代谢（如 酵解作用、氨基酸、 脂肪酸 和 核苷酸 代谢）和一些蛋白的修饰作用（如磷酸化）在胞质溶胶中进行。悬浮在胞质溶胶中的 细胞器 ，有具界膜的和无界膜的，它们参与了细胞的多种 代谢途径 。内含物则是在细胞生命代谢过程中形成的产物，如 糖原 、色素粒、脂肪滴等。
细胞质研究史
1665 英国人Robert Hook用自己设计与制造的 显微镜 （放大 倍数 为40-140倍，图1-1)观察了软木（ 栎属 皮)的 薄片 ，第一次描述了植物细胞的构造，并首次用拉丁文cella（小室)这个词来称呼他所看到的类似蜂巢的极小的封闭状小室（实际上只是观察到到纤维质的 细胞壁 )。
1672，1682英国人Nehemaih Grew出版了两卷植物显微图谱，注意到了植物细胞中细胞壁与细胞质的区别。
1846 德国人H. von Mohl研究了植物 原生质 ，发表了“identifies protoplasm as the substance of cells”。
1865 德国人J. von Suchs 发现 叶绿体 。
1868 英国 人T. H. Huxley 在 爱丁堡 作题为“生命的物质基础”（the physical basis of life）的演讲报告时首次把原生质的概念介绍给了英国公众。
1882 德国人E. Strasburger 提出细胞质（cytoplasm）和核质（nucleoplasm）的概念。
1898 意大利人C. Golgi 用银染法观察 高尔基体 。
50年代就有人看到叶绿体中有呈孚尔根反应的颗粒存在，推测其中可能有 脱氧核糖核酸 。
1962年，Ris和 Plant 用电镜观察 衣藻属 ， 玉蜀黍属 等植物的 叶绿体 超薄切片 ，发现在基质中电子密度较低的部分有20.5nm左右的细纤维。用DNA酶处理时消失，证明是DNA。